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ARCHITECTURE AND TOOLS FOR THE QUERY OF ANTIBODY AND T-CELL RECEPTOR SEQUENCING DATA REPOSITORIES FOR ENABLING IMPROVED PERSONALIZED MEDICINE AND IMMUNOTHERAPY

Descripción del proyecto

Una red internacional de repositorios de datos para estudios inmunológicos avanzados

Muchos tratamientos modernos implican el sistema inmunitario adaptativo, que ha desarrollado una amplia variedad de receptores inmunitarios para detectar y eliminar agentes patógenos y células cancerosas. Los conjuntos de datos y secuencias que caracterizan este repertorio de receptores inmunitarios adaptativos (AIRR-seq, por sus siglas en inglés) podrían revolucionar la investigación sobre vacunas y el desarrollo de tratamientos contra las enfermedades autoinmunitarias y el cáncer. Actualmente, cada laboratorio organiza estos datos del AIRR-seq mediante una variedad de herramientas y tecnologías. Compartir estos datos en instituciones y estudios de enfermedades en todo el mundo mejorará la investigación traslacional y fundamental. El proyecto iReceptor Plus, financiado con fondos europeos y compuesto por un consorcio de investigadores canadienses y europeos, aborda la optimización del intercambio de datos del AIRR-seq entre el público y los socios industriales, analizando los datos procedentes de muchas fuentes y ampliando el tamaño y el número de repositorios integrados en la red.

Objetivo

Background: Many cutting-edge therapies rely on manipulating the adaptive immune system, which has evolved a vast diversity (repertoire) of immune receptors to recognize and remove pathogens and cancer cells. The sequence-data sets characterizing this Adaptive Immune Receptor Repertoire (i.e. AIRR-seq data) have the potential to revolutionize vaccine research and the development of therapies against autoimmune diseases and cancer; however, AIRR-seq data are typically stored and curated by individual labs, using a variety of tools and technologies. Sharing these data in a common way across disease studies, labs, and institutions around the world will improve our ability to recognize patterns in basic research and clinical trials, and increase our confidence in these patterns. The existing iReceptor Platform uses community-developed standards to facilitate sharing of AIRR-seq data by enabling queries across a system of distributed data repositories.

Project: The iReceptor Plus consortium of researchers from Europe and Canada will address several key challenges to optimally sharing AIRR-seq data among public and industrial partners: protecting patient privacy and the intellectual property of partners, performing complex analyses on data brought together from many sources, and expanding the size and number of repositories that can be integrated in the network.

Impact: The iReceptor Plus project will facilitate sharing of AIRR-seq data among multiple institutions, including biopharmaceutical companies and researchers working with human confidential data, across multiple diseases, treatments and populations. This will lead to a better understanding of the causes of infectious and autoimmune diseases and cancer, which can lead to early detection and suggest novel therapies. These improvements will reduce the social and economic burden of these diseases, advance Europe and Canada’s leadership role in immunotherapy, and contribute to improved patient care worldwide

Convocatoria de propuestas

H2020-SC1-BHC-2018-2020

Consulte otros proyectos de esta convocatoria

Convocatoria de subcontratación

H2020-SC1-2018-Single-Stage-RTD

Régimen de financiación

RIA - Research and Innovation action

Coordinador

BAR ILAN UNIVERSITY
Aportación neta de la UEn
€ 975 750,00
Dirección
BAR ILAN UNIVERSITY CAMPUS
52900 Ramat Gan
Israel

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Tipo de actividad
Higher or Secondary Education Establishments
Enlaces
Coste total
€ 975 750,00

Participantes (20)