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ARCHITECTURE AND TOOLS FOR THE QUERY OF ANTIBODY AND T-CELL RECEPTOR SEQUENCING DATA REPOSITORIES FOR ENABLING IMPROVED PERSONALIZED MEDICINE AND IMMUNOTHERAPY

Description du projet

Un réseau international de référentiels de données pour des études immunologiques avancées

De nombreuses thérapies modernes font intervenir le système immunitaire adaptatif, qui a développé un large éventail de récepteurs immunitaires pour reconnaître et éliminer les agents pathogènes et les cellules cancéreuses. Les ensembles de séquences/données caractérisant ce référentiel de récepteurs immunitaires adaptatifs (AIRR‑seq) pourraient révolutionner la recherche sur les vaccins et le développement de thérapies contre les maladies auto‑immunes et le cancer. Actuellement, les données AIRR‑seq sont conservées par des laboratoires individuels, au moyen d’une variété d’outils et de technologies. Le partage de ces données entre les études sur les maladies et les institutions du monde entier permettra d’améliorer la recherche fondamentale et translationnelle. Le projet iReceptor Plus, financé par l’UE et composé d’un consortium de chercheurs européens et canadiens, vise à optimiser le partage des données AIRR‑seq entre partenaires publics et industriels, en effectuant des analyses sur des données émanant de nombreuses sources et en augmentant la taille et le nombre des référentiels intégrés au réseau.

Objectif

Background: Many cutting-edge therapies rely on manipulating the adaptive immune system, which has evolved a vast diversity (repertoire) of immune receptors to recognize and remove pathogens and cancer cells. The sequence-data sets characterizing this Adaptive Immune Receptor Repertoire (i.e. AIRR-seq data) have the potential to revolutionize vaccine research and the development of therapies against autoimmune diseases and cancer; however, AIRR-seq data are typically stored and curated by individual labs, using a variety of tools and technologies. Sharing these data in a common way across disease studies, labs, and institutions around the world will improve our ability to recognize patterns in basic research and clinical trials, and increase our confidence in these patterns. The existing iReceptor Platform uses community-developed standards to facilitate sharing of AIRR-seq data by enabling queries across a system of distributed data repositories.

Project: The iReceptor Plus consortium of researchers from Europe and Canada will address several key challenges to optimally sharing AIRR-seq data among public and industrial partners: protecting patient privacy and the intellectual property of partners, performing complex analyses on data brought together from many sources, and expanding the size and number of repositories that can be integrated in the network.

Impact: The iReceptor Plus project will facilitate sharing of AIRR-seq data among multiple institutions, including biopharmaceutical companies and researchers working with human confidential data, across multiple diseases, treatments and populations. This will lead to a better understanding of the causes of infectious and autoimmune diseases and cancer, which can lead to early detection and suggest novel therapies. These improvements will reduce the social and economic burden of these diseases, advance Europe and Canada’s leadership role in immunotherapy, and contribute to improved patient care worldwide

Appel à propositions

H2020-SC1-BHC-2018-2020

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Sous appel

H2020-SC1-2018-Single-Stage-RTD

Coordinateur

BAR ILAN UNIVERSITY
Contribution nette de l'UE
€ 975 750,00
Adresse
BAR ILAN UNIVERSITY CAMPUS
52900 Ramat Gan
Israël

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Type d’activité
Higher or Secondary Education Establishments
Liens
Coût total
€ 975 750,00

Participants (20)