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Using CRISPR genome screens and dual transcriptome analyses to dissect host-pathogen interactions in tuberculosis

Description du projet

Un criblage génomique pour découvrir de nouvelles cibles thérapeutiques contre la tuberculose

La tuberculose est un problème de santé à l’échelle mondiale, aggravé par l’apparition d’agents pathogènes résistants aux médicaments. Comprendre l’interaction entre l’agent pathogène et l’hôte est nécessaire pour développer de nouveaux traitements dirigés vers l’hôte qui accroissent la capacité du système immunitaire de lutter contre Mycobacterium tuberculosis. Le projet Host-TB, financé par l’UE, utilisera la technologie d’édition CRISPR pour effectuer un criblage génomique chez des macrophages humains infectés par Mycobacterium tuberculosis. L’objectif principal consiste à identifier des gènes impliqués dans l’interaction avec l’agent pathogène et à caractériser de manière exhaustive les voies associées. Les résultats du projet sont susceptibles d’aboutir à l’identification de nouvelles cibles thérapeutiques contre la tuberculose.

Objectif

With more than 10 million cases annually, tuberculosis (TB) remains a global health problem. TB epidemic is exacerbated by the spread of multidrug-resistant TB. Host-directed therapies (HDTs) can improve immune mechanisms by augmenting the ability of host cells to kill M. tuberculosis (Mtb) or by modulating the immune response to prevent excessive inflammation, cell death and tissue damage. Progress with HDT development has been slowed down by the limited understanding of host-pathogen interactions during Mtb infection. Screens of the whole human genome can identify novel genes involved in the immune responses to Mtb infection and susceptibility to TB. Previously, we successfully used genome-wide association studies to identify human genes associated with susceptibility to TB. Here, we will for the first time use the groundbreaking CRISPR technology to screen the human genome in macrophages infected with Mtb and discover genes that are critically involved in host-pathogen interactions. Then, we will comprehensively characterise pathways that mediate impacts of these genes on both the human macrophage and the intracellular Mtb bacilli using dual transcriptome analyses and high-throughput microscopy assays. This novel approach will dissect crucial mechanisms of host-pathogen interaction during Mtb infection and will point to new targets for HDTs of TB.

Mots‑clés

Régime de financement

ERC-ADG - Advanced Grant

Institution d’accueil

THE CHANCELLOR MASTERS AND SCHOLARS OF THE UNIVERSITY OF CAMBRIDGE
Contribution nette de l'UE
€ 1 366 940,49
Adresse
TRINITY LANE THE OLD SCHOOLS
CB2 1TN Cambridge
Royaume-Uni

Voir sur la carte

Région
East of England East Anglia Cambridgeshire CC
Type d’activité
Higher or Secondary Education Establishments
Liens
Coût total
€ 1 366 940,49

Bénéficiaires (2)