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Using CRISPR genome screens and dual transcriptome analyses to dissect host-pathogen interactions in tuberculosis

Projektbeschreibung

Eine genomweite Untersuchung von neuen Therapiezielen bei Tuberkulose

Tuberkulose ist eine weltweite medizinische Herausforderung, die durch arzneimittelresistente Pathogene erschwert wird. Damit neue wirtsgerichtete Therapien entwickelt werden können, mit denen das Immunsystem Mycobacterium tuberculosis besser bekämpfen kann, braucht es Wissen um die Interaktion zwischen Wirt und Erreger. Das EU-finanzierte Projekt Host-TB wird mithilfe der CRISPR-Genomeditierung eine genomweite Untersuchung von mit Mycobacterium tuberculosis infizierten menschlichen Makrophagen durchführen. Dabei sollen vor allem Gene identifiziert werden, die an der Interaktion mit dem Pathogen beteiligt sind, und die zugehörigen Signalwege umfassend charakterisiert werden. Mithilfe der Projektergebnisse könnten sich neue Therapiezielen bei Tuberkulose finden lassen.

Ziel

With more than 10 million cases annually, tuberculosis (TB) remains a global health problem. TB epidemic is exacerbated by the spread of multidrug-resistant TB. Host-directed therapies (HDTs) can improve immune mechanisms by augmenting the ability of host cells to kill M. tuberculosis (Mtb) or by modulating the immune response to prevent excessive inflammation, cell death and tissue damage. Progress with HDT development has been slowed down by the limited understanding of host-pathogen interactions during Mtb infection. Screens of the whole human genome can identify novel genes involved in the immune responses to Mtb infection and susceptibility to TB. Previously, we successfully used genome-wide association studies to identify human genes associated with susceptibility to TB. Here, we will for the first time use the groundbreaking CRISPR technology to screen the human genome in macrophages infected with Mtb and discover genes that are critically involved in host-pathogen interactions. Then, we will comprehensively characterise pathways that mediate impacts of these genes on both the human macrophage and the intracellular Mtb bacilli using dual transcriptome analyses and high-throughput microscopy assays. This novel approach will dissect crucial mechanisms of host-pathogen interaction during Mtb infection and will point to new targets for HDTs of TB.

Schlüsselbegriffe

Finanzierungsplan

ERC-ADG - Advanced Grant

Gastgebende Einrichtung

THE CHANCELLOR MASTERS AND SCHOLARS OF THE UNIVERSITY OF CAMBRIDGE
Netto-EU-Beitrag
€ 1 366 940,49
Adresse
TRINITY LANE THE OLD SCHOOLS
CB2 1TN Cambridge
Vereinigtes Königreich

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Region
East of England East Anglia Cambridgeshire CC
Aktivitätstyp
Higher or Secondary Education Establishments
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Gesamtkosten
€ 1 366 940,49

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