Proteome profiling using plasmonic nanopore sensors

Projektinformationen

NanoProt-ID

ID Finanzhilfevereinbarung: 833399

DOI

10.3030/833399

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 19 April 2019

Startdatum 1 August 2019

Enddatum 31 Juli 2024

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten

€ 2 498 869,00

EU-Beitrag

€ 2 498 869,00

Koordiniert durch

TECHNION - ISRAEL INSTITUTE OF TECHNOLOGY
Israel

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Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (14)

Over 30-Fold Enhancement in DNA Translocation Dynamics through Nanoscale Pores Coated with an Anionic Surfactant

Autoren: Neeraj Soni; Navneet Chandra Verma; Noam Talor; Amit Meller
Veröffentlicht in: Nano Letters, Ausgabe 23, 2023, Seite(n) 4609-4616, ISSN 1530-6984
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.nanolett.3c01096

The emerging landscape of single-molecule protein sequencing technologies

Autoren: Javier Antonio Alfaro, Peggy Bohländer, Mingjie Dai, Mike Filius, Cecil J. Howard, Xander F. van Kooten, Shilo Ohayon, Adam Pomorski, Sonja Schmid, Aleksei Aksimentiev, Eric V. Anslyn, Georges Bedran, Chan Cao, Mauro Chinappi, Etienne Coyaud, Cees Dekker, Gunnar Dittmar, Nicholas Drachman, Rienk Eelkema, David Goodlett, Sébastien Hentz, Umesh Kalathiya, Neil L. Kelleher, Ryan T. Kelly, Zvi Kelma
Veröffentlicht in: Nature Methods, 2021, ISSN 1548-7091
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41592-021-01143-1

Full‐Length Single Protein Molecules Tracking and Counting in Thin Silicon Channels

Autoren: Shilo Ohayon, Liran Taib, Navneet Chandra Verma, Marzia Iarossi, Ivy Bhattacharya, Barak Marom, Diana Huttner, Amit Meller
Veröffentlicht in: Advanced Materials, Ausgabe 36, 2024, ISSN 0935-9648
Herausgeber: United Nations Industrial Developement Organization
DOI: 10.1002/adma.202314319

Microfluidic device for coupling isotachophoretic sample focusing with nanopore single-molecule sensing

Autoren: Joshua D Spitzberg; Xander F. van Kooten; Moran Bercovici; Amit Meller; Amit Meller
Veröffentlicht in: Nanoscale, Ausgabe 12, 2020, Seite(n) 17805 - 17811, ISSN 2040-3364
Herausgeber: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d0nr05000h

Fast and Deterministic Fabrication of Sub‑5 Nanometer Solid-State Pores by Feedback-Controlled Laser Processing

Autoren: Eran Zvuloni, Adam Zrehen, Tal Gilboa, Amit Meller
Veröffentlicht in: ACS Nano, 2021, ISSN 1936-0851
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acsnano.1c03773

Quantification of mRNA Expression Using Single-Molecule Nanopore Sensing

Autoren: Yana Rozevsky, Tal Gilboa, Xander F. van Kooten, Dennis Kobelt, Diana Huttner, Ulrike Stein, Amit Meller
Veröffentlicht in: ACS Nano, Ausgabe 14/10, 2020, Seite(n) 13964-13974, ISSN 1936-0851
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acsnano.0c06375

Nanopore-based technologies beyond DNA sequencing

Autoren: Yi-Lun Ying; Zheng-Li Hu; Shengli Zhang; Yujia Qing; Alessio Fragasso; Giovanni Maglia; Amit Meller; Hagan Bayley; Cees Dekker; Yi-Tao Long
Veröffentlicht in: Nature Nanotechnology, Ausgabe 17, 2022, Seite(n) 1136-1146, ISSN 1748-3387
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41565-022-01193-2

On-chip protein separation with single-molecule resolution

Autoren: Adam Zrehen, Shilo Ohayon, Diana Huttner, Amit Meller
Veröffentlicht in: Scientific Reports, Ausgabe 10/1, 2020, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-020-72463-z

Purely electrical SARS-CoV-2 sensing based on single-molecule counting

Autoren: Xander F. van Kooten; Yana Rozevsky; Yulia Marom; Efrat Ben Sadeh; Amit Meller
Veröffentlicht in: Nanoscale, Ausgabe 14, 2022, Seite(n) 4977-4986, ISSN 2040-3364
Herausgeber: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d1nr07787b

Nanopore Identification of Single Nucleotide Mutations in Circulating Tumor DNA by Multiplexed Ligation

Autoren: Nitza Burck, Tal Gilboa, Abhilash Gadi, Michelle Patkin Nehrer, Robert J Schneider, Amit Meller
Veröffentlicht in: Clinical Chemistry, 2021, ISSN 0009-9147
Herausgeber: American Association for Clinical Chemistry, Inc.
DOI: 10.1093/clinchem/hvaa328

Simulation of single-protein nanopore sensing shows feasibility for whole-proteome identification.

Autoren: Shilo Ohayon; Arik Girsault; Maisa Nasser; Shai S. Shen-Orr; Amit Meller; Amit Meller
Veröffentlicht in: PLoS Computational Biology, Vol 15, Iss 5, p e1007067 (2019), Ausgabe 15, 2019, Seite(n) e1007067, ISSN 1553-734X
Herausgeber: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pcbi.1007067

Single-File Translocation Dynamics of SDS-Denatured, Whole Proteins through Sub-5 nm Solid-State Nanopores

Autoren: Soni, Neeraj; Freundlich, Noam; Ohayon, Shilo; Huttner, Diana; Meller, Amit
Veröffentlicht in: ACS Nano, Ausgabe 5, 2022, Seite(n) 11405-11414, ISSN 1936-0851
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acsnano.2c05391

On-Chip Stretching, Sorting, and Electro-Optical Nanopore Sensing of Ultralong Human Genomic DNA

Autoren: Adam Zrehen, Diana Huttner, Amit Meller
Veröffentlicht in: ACS Nano, Ausgabe 13/12, 2019, Seite(n) 14388-14398, ISSN 1936-0851
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acsnano.9b07873

Lifetime-based analysis of binary fluorophores mixtures in the low photon count limit

Autoren: Maisa Nasser, Amit Meller
Veröffentlicht in: iScience, 2021, ISSN 2589-0042
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.isci.2021.103554

Non-peer reviewed articles (1)

Are nanopore technologies ready for the proteomic challenge primetime?

Autoren: Amit Meller
Veröffentlicht in: Molecular Cell, Ausgabe 82, 2022, ISSN 1097-2765
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2021.12.018