Mechanistic principles of regulation by small RNAs

Información del proyecto

RegRNA

Identificador del acuerdo de subvención: 833598

DOI

10.3030/833598

Fecha de la firma de la CE 18 Abril 2019

Fecha de inicio 1 Septiembre 2019

Fecha de finalización 31 Agosto 2026

Financiado con arreglo a

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coste total

€ 2 278 125,00

Aportación de la UE

€ 2 278 125,00

Coordinado por

THE HEBREW UNIVERSITY OF JERUSALEM
Israel

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Publicaciones

Peer reviewed articles (9)

Inferring the contribution of small RNAs to changes in gene expression in response to stress

Autores: Meshi Barsheshet, Shira Fisher, Hanah Margalit
Publicado en: NAR Genomics and Bioinformatics, Edición March 4, 2022, 2022, ISSN 2631-9268
Editor: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nargab/lqac015

Prediction of Novel Bacterial Small RNAs From RIL-Seq RNA–RNA Interaction Data

Autores: Amir Bar, Liron Argaman, Yael Altuvia, Hanah Margalit
Publicado en: Frontiers in Microbiology, Edición May 21, 2021, 2021, ISSN 1664-302X
Editor: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fmicb.2021.635070

Hierarchy in Hfq Chaperon Occupancy of Small RNA Targets Plays a Major Role in Their Regulation

Autores: Raya Faigenbaum-Romm, Avichai Reich, Yair E. Gatt, Meshi Barsheshet, Liron Argaman, Hanah Margalit
Publicado en: Cell Reports, Edición 30/9, 2020, Página(s) 3127-3138.e6, ISSN 2211-1247
Editor: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2020.02.016

Global RNA interactome of Salmonella discovers a 5′ UTR sponge for the MicF small RNA that connects membrane permeability to transport capacity

Autores: Gianluca Matera, Yael Altuvia, Milan Gerovac, Youssef El Mouali, Hanah Margalit, Joerg Vogel
Publicado en: Molecular Cell, Edición January 20, 2022, 2022, Página(s) 629-644, ISSN 1097-2765
Editor: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2021.12.030

Formation of a membraneless compartment regulates bacterial virulence

Autores: Lior Aroeti, Netanel Elbaz, Raya Faigenbaum-Romm, Oren Yakovian, Yael Altuvia, Liron Argaman, Naama Katsowich, Michal Bejerano-Sagie, Miriam Ravins, Hanah Margalit, Sigal Ben-Yehuda, Ilan Rosenshine
Publicado en: Nature Communications, Edición 16, 2025, ISSN 2041-1723
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-025-58829-9

Unraveling the interplay between a small RNA and RNase E in bacteria

Autores: Meshi Barsheshet Vigoda, Liron Argaman, Mark Kournos, Hanah Margalit
Publicado en: Nucleic Acids Research, Edición 52, 2024, Página(s) 8947-8966, ISSN 0305-1048
Editor: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkae621

TRS: a method for determining transcript termini from RNAtag-seq sequencing data

Autores: Amir Bar, Liron Argaman, Michal Eldar, Hanah Margalit
Publicado en: Nature Communications, Edición 29 November 2023, 2023, Página(s) 7843, ISSN 2041-1723
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-43534-2

The impact of Hfq-mediated sRNA-mRNA interactome on the virulence of enteropathogenic Escherichia coli

Autores: Sivan Pearl Mizrahi, Nenanel Elbaz, Liron Argaman, Yael Altuvia, Naama Katsowich, Yaakov Socol, Amir Bar, Ilan Rosenshine, Hanah Margalit
Publicado en: Scince Advances, Edición October, 27 2021, 2021, ISSN 2375-2548
Editor: Science
DOI: 10.1126/sciadv.abi8228

RIL-seq reveals extensive involvement of small RNAs in virulence and capsule regulation in hypervirulent <i>Klebsiella pneumoniae</i>

Autores: Kwok Jian Goh, Yael Altuvia, Liron Argaman, Yair Raz, Amir Bar, Trevor Lithgow, Hanah Margalit, Yunn-Hwen Gan
Publicado en: Nucleic Acids Research, Edición 52, 2024, Página(s) 9119-9138, ISSN 0305-1048
Editor: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkae440