Mechanistic principles of regulation by small RNAs

Projektinformationen

RegRNA

ID Finanzhilfevereinbarung: 833598

DOI

10.3030/833598

EK-Unterschriftsdatum 18 April 2019

Startdatum 1 September 2019

Enddatum 31 August 2026

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten

€ 2 278 125,00

EU-Beitrag

€ 2 278 125,00

Koordiniert durch

THE HEBREW UNIVERSITY OF JERUSALEM
Israel

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Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (9)

Inferring the contribution of small RNAs to changes in gene expression in response to stress

Autoren: Meshi Barsheshet, Shira Fisher, Hanah Margalit
Veröffentlicht in: NAR Genomics and Bioinformatics, Ausgabe March 4, 2022, 2022, ISSN 2631-9268
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nargab/lqac015

Prediction of Novel Bacterial Small RNAs From RIL-Seq RNA–RNA Interaction Data

Autoren: Amir Bar, Liron Argaman, Yael Altuvia, Hanah Margalit
Veröffentlicht in: Frontiers in Microbiology, Ausgabe May 21, 2021, 2021, ISSN 1664-302X
Herausgeber: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fmicb.2021.635070

Hierarchy in Hfq Chaperon Occupancy of Small RNA Targets Plays a Major Role in Their Regulation

Autoren: Raya Faigenbaum-Romm, Avichai Reich, Yair E. Gatt, Meshi Barsheshet, Liron Argaman, Hanah Margalit
Veröffentlicht in: Cell Reports, Ausgabe 30/9, 2020, Seite(n) 3127-3138.e6, ISSN 2211-1247
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2020.02.016

Global RNA interactome of Salmonella discovers a 5′ UTR sponge for the MicF small RNA that connects membrane permeability to transport capacity

Autoren: Gianluca Matera, Yael Altuvia, Milan Gerovac, Youssef El Mouali, Hanah Margalit, Joerg Vogel
Veröffentlicht in: Molecular Cell, Ausgabe January 20, 2022, 2022, Seite(n) 629-644, ISSN 1097-2765
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2021.12.030

Formation of a membraneless compartment regulates bacterial virulence

Autoren: Lior Aroeti, Netanel Elbaz, Raya Faigenbaum-Romm, Oren Yakovian, Yael Altuvia, Liron Argaman, Naama Katsowich, Michal Bejerano-Sagie, Miriam Ravins, Hanah Margalit, Sigal Ben-Yehuda, Ilan Rosenshine
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 16, 2025, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-025-58829-9

Unraveling the interplay between a small RNA and RNase E in bacteria

Autoren: Meshi Barsheshet Vigoda, Liron Argaman, Mark Kournos, Hanah Margalit
Veröffentlicht in: Nucleic Acids Research, Ausgabe 52, 2024, Seite(n) 8947-8966, ISSN 0305-1048
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkae621

TRS: a method for determining transcript termini from RNAtag-seq sequencing data

Autoren: Amir Bar, Liron Argaman, Michal Eldar, Hanah Margalit
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 29 November 2023, 2023, Seite(n) 7843, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-43534-2

The impact of Hfq-mediated sRNA-mRNA interactome on the virulence of enteropathogenic Escherichia coli

Autoren: Sivan Pearl Mizrahi, Nenanel Elbaz, Liron Argaman, Yael Altuvia, Naama Katsowich, Yaakov Socol, Amir Bar, Ilan Rosenshine, Hanah Margalit
Veröffentlicht in: Scince Advances, Ausgabe October, 27 2021, 2021, ISSN 2375-2548
Herausgeber: Science
DOI: 10.1126/sciadv.abi8228

RIL-seq reveals extensive involvement of small RNAs in virulence and capsule regulation in hypervirulent <i>Klebsiella pneumoniae</i>

Autoren: Kwok Jian Goh, Yael Altuvia, Liron Argaman, Yair Raz, Amir Bar, Trevor Lithgow, Hanah Margalit, Yunn-Hwen Gan
Veröffentlicht in: Nucleic Acids Research, Ausgabe 52, 2024, Seite(n) 9119-9138, ISSN 0305-1048
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkae440