Mechanistic principles of regulation by small RNAs

Informations projet

RegRNA

N° de convention de subvention: 833598

DOI

10.3030/833598

Date de signature de la CE 18 Avril 2019

Date de début 1 Septembre 2019

Date de fin 31 Août 2026

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 2 278 125,00

Contribution de l’UE

€ 2 278 125,00

Coordonné par

THE HEBREW UNIVERSITY OF JERUSALEM
Israel

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Publications

Peer reviewed articles (9)

Inferring the contribution of small RNAs to changes in gene expression in response to stress

Auteurs: Meshi Barsheshet, Shira Fisher, Hanah Margalit
Publié dans: NAR Genomics and Bioinformatics, Numéro March 4, 2022, 2022, ISSN 2631-9268
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nargab/lqac015

Prediction of Novel Bacterial Small RNAs From RIL-Seq RNA–RNA Interaction Data

Auteurs: Amir Bar, Liron Argaman, Yael Altuvia, Hanah Margalit
Publié dans: Frontiers in Microbiology, Numéro May 21, 2021, 2021, ISSN 1664-302X
Éditeur: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fmicb.2021.635070

Hierarchy in Hfq Chaperon Occupancy of Small RNA Targets Plays a Major Role in Their Regulation

Auteurs: Raya Faigenbaum-Romm, Avichai Reich, Yair E. Gatt, Meshi Barsheshet, Liron Argaman, Hanah Margalit
Publié dans: Cell Reports, Numéro 30/9, 2020, Page(s) 3127-3138.e6, ISSN 2211-1247
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2020.02.016

Global RNA interactome of Salmonella discovers a 5′ UTR sponge for the MicF small RNA that connects membrane permeability to transport capacity

Auteurs: Gianluca Matera, Yael Altuvia, Milan Gerovac, Youssef El Mouali, Hanah Margalit, Joerg Vogel
Publié dans: Molecular Cell, Numéro January 20, 2022, 2022, Page(s) 629-644, ISSN 1097-2765
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2021.12.030

Formation of a membraneless compartment regulates bacterial virulence

Auteurs: Lior Aroeti, Netanel Elbaz, Raya Faigenbaum-Romm, Oren Yakovian, Yael Altuvia, Liron Argaman, Naama Katsowich, Michal Bejerano-Sagie, Miriam Ravins, Hanah Margalit, Sigal Ben-Yehuda, Ilan Rosenshine
Publié dans: Nature Communications, Numéro 16, 2025, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-025-58829-9

Unraveling the interplay between a small RNA and RNase E in bacteria

Auteurs: Meshi Barsheshet Vigoda, Liron Argaman, Mark Kournos, Hanah Margalit
Publié dans: Nucleic Acids Research, Numéro 52, 2024, Page(s) 8947-8966, ISSN 0305-1048
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkae621

TRS: a method for determining transcript termini from RNAtag-seq sequencing data

Auteurs: Amir Bar, Liron Argaman, Michal Eldar, Hanah Margalit
Publié dans: Nature Communications, Numéro 29 November 2023, 2023, Page(s) 7843, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-43534-2

The impact of Hfq-mediated sRNA-mRNA interactome on the virulence of enteropathogenic Escherichia coli

Auteurs: Sivan Pearl Mizrahi, Nenanel Elbaz, Liron Argaman, Yael Altuvia, Naama Katsowich, Yaakov Socol, Amir Bar, Ilan Rosenshine, Hanah Margalit
Publié dans: Scince Advances, Numéro October, 27 2021, 2021, ISSN 2375-2548
Éditeur: Science
DOI: 10.1126/sciadv.abi8228

RIL-seq reveals extensive involvement of small RNAs in virulence and capsule regulation in hypervirulent <i>Klebsiella pneumoniae</i>

Auteurs: Kwok Jian Goh, Yael Altuvia, Liron Argaman, Yair Raz, Amir Bar, Trevor Lithgow, Hanah Margalit, Yunn-Hwen Gan
Publié dans: Nucleic Acids Research, Numéro 52, 2024, Page(s) 9119-9138, ISSN 0305-1048
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkae440