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A NOVEL BREEDING STRATEGY USING MULTIPLEX GENOME EDITING IN MAIZE

Descrizione del progetto

Editing del genoma e speed breeding per una migliore resa delle colture

Il tasso di selettocoltura di nuove varietà ad alto rendimento di colture agricole è attualmente troppo basso per affrontare le imminenti minacce alla sicurezza alimentare. Il progetto BREEDIT, finanziato dall’UE, introdurrà un’innovativa strategia di selezione vegetale per valutare rapidamente le combinazioni di potenziali alleli, una delle due o più versioni di un gene, che contribuiscono alla resa. Si valuterà l’effetto combinatorio delle mutazioni modificate a livello genomico sulla crescita e la resa delle piante. Per fare questo, saranno introdotte piante con diverse miscele di mutazioni modificate a livello genomico in oltre 80 geni noti legati al rendimento in un approccio trasversale. Il progetto getterà le basi per sviluppare strategie di selettocoltura su misura che utilizzano le migliori combinazioni possibili di alleli benefici.

Obiettivo

Feeding the growing world population under changing climate conditions poses an unprecedented challenge on global agriculture and our current pace to breed new high yielding crop varieties is too low to face the imminent threats on food security. This ERC project proposes a novel crossing scheme that allows for an expeditious evaluation of combinations of potential yield contributing alleles by unifying ‘classical’ breeding with gene-centric molecular biology. The acronym BREEDIT, a word fusion of breeding and editing, reflects the basic concept of combining breeding with multiplex genome editing of yield related genes. By introducing plants with distinct combinations of genome edited mutations in more than 80 known yield related genes into a crossing scheme, the combinatorial effect of these mutations on plant growth and yield will be evaluated. Subsequent rounds of crossings will increase the number of stacked gene-edits per plant, thus increasing the combinatorial complexity. Phenotypic evaluations throughout plant development will be done on our in-house automated image-analysis based phenotyping platform. The nature and frequency of Cas9-mediated mutations in the entire plant collection will be characterised by multiplex amplicon sequencing to follow the efficiency of CRISPR-cas9 genome editing and to identify the underlying combinations of genes that cause beneficial phenotypes (genetic gain). The obtained knowledge on yield regulatory networks can be directly implemented into current molecular breeding programs and the project will provide the basis to develop targeted breeding schemes implementing the optimal combinations of beneficial alleles into elite material.
BREEDIT will be a major step forward in integrating basic knowledge on genes with plant breeding and has the potential to provoke a paradigm shift in improving crop yield.

Meccanismo di finanziamento

ERC-ADG - Advanced Grant

Istituzione ospitante

VIB VZW
Contribution nette de l'UE
€ 2 474 790,00
Indirizzo
SUZANNE TASSIERSTRAAT 1
9052 ZWIJNAARDE - GENT
Belgio

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Regione
Vlaams Gewest Prov. Oost-Vlaanderen Arr. Gent
Tipo di attività
Research Organisations
Collegamenti
Costo totale
€ 2 474 790,00

Beneficiari (1)