Description du projet
La niche de la moelle osseuse dans la santé et la maladie
Les cellules souches hématopoïétiques résident dans un microenvironnement spécifique de la moelle osseuse, appelé niche. La niche englobe différents types de cellules, la matrice extracellulaire et des facteurs paracrines qui soutiennent collectivement l’état indifférencié et la capacité d’auto-renouvellement des cellules souches. Le projet SyLeNCe, financé par l’UE, entend disséquer l’interaction entre les composants de la niche pendant l’homéostasie et la maladie. Il se concentrera principalement sur la caractérisation détaillée des relations cellulaires au cours de la transformation maligne dans la leucémie ainsi que sur le développement et la progression de la maladie. Les travaux de SyLeNCe apporteront une vision plus globale de la niche des cellules souches et pourraient révéler de nouveaux candidats au traitement de la leucémie.
Objectif
Our understanding of the different layers of organization in tissues remains limited. Stem cell niches offer a tightly controlled environment and a unique opportunity to look into this question. Reductionist approaches have been proven highly efficient dissecting the complexity of stem cell niches in a unidirectional fashion. However, this approach fails to recognize the tri-dimensional complexity of tissue organization. Hence we propose a systems biology approach based on low input and single cell RNA sequencing of bone marrow niche populations in order to establish not only the molecular landscape of cells that comprise the stem cell niche in homeostasis and disease but also the lineage relationships that may exist between cells in the stroma. Using the mouse bone marrow niche during neoplastic transformation to acute myeloid leukemia (AML), we will first unravel the cellular and molecular interactions that constitute the tumor microenvironment during disease development and progression using multi parametric flow cytometry and RNA-sequencing. Information gathered from these experiments will also provide a list of molecular candidates for therapeutic intervention in AML. We will validate those candidate cell populations and genetic pathways by means of gain and loss-of-function assays in vitro and in vivo using murine models and primary human AML samples. Completion of our interdisciplinary project will provide, for the first time a complete transcriptional and cellular map of a tissue, revealing the heterotypic interactions that define the real nature of a tissue. Perhaps then we could start to appreciate the elegant complexity of the ecosystem that the stem cell and its niche share. I hope SyLeNCe will facilitate the description of novel vulnerabilities that could be explored therapeutically for the treatment of acute myeloid leukaemia having an impact on the quality of life and long-term survival of AML patients.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
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MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)Coordinateur
31008 Pamplona
Espagne