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Synapses between Leukaemia and its Neighbouring Cells

Projektbeschreibung

Die Knochenmarksnische bei Gesundheit und Krankheit

Hämatopoetische Stammzellen sitzen in einer bestimmten Mikroumgebung des Knochenmarks namens Nischen. Die Nische enthält verschiedene Zellarten, die extrazelluläre Matrix und parakrine Faktoren, die gemeinsam den undifferenzierten Zustand und die Selbsterneuerungsfähigkeit der Stammzellen ermöglichen. Das EU-finanzierte Projekt SyLeNCe will die Wechselwirkung zwischen den Bestandteilen der Nische während der Homöostase und bei Krankheiten untersuchen. Der Schwerpunkt liegt auf der detaillierten Charakterisierung der Zellverbindungen bei der malignen Transformation bei Leukämie sowie bei der Entwicklung und dem Verlauf von Krankheiten. Die Arbeit von SyLeNCe wird einen ganzheitlicheren Blick auf die Stammzellennische ermöglichen und könnte Kandidaten für die Behandlung von Leukämie offenbaren.

Ziel

Our understanding of the different layers of organization in tissues remains limited. Stem cell niches offer a tightly controlled environment and a unique opportunity to look into this question. Reductionist approaches have been proven highly efficient dissecting the complexity of stem cell niches in a unidirectional fashion. However, this approach fails to recognize the tri-dimensional complexity of tissue organization. Hence we propose a systems biology approach based on low input and single cell RNA sequencing of bone marrow niche populations in order to establish not only the molecular landscape of cells that comprise the stem cell niche in homeostasis and disease but also the lineage relationships that may exist between cells in the stroma. Using the mouse bone marrow niche during neoplastic transformation to acute myeloid leukemia (AML), we will first unravel the cellular and molecular interactions that constitute the tumor microenvironment during disease development and progression using multi parametric flow cytometry and RNA-sequencing. Information gathered from these experiments will also provide a list of molecular candidates for therapeutic intervention in AML. We will validate those candidate cell populations and genetic pathways by means of gain and loss-of-function assays in vitro and in vivo using murine models and primary human AML samples. Completion of our interdisciplinary project will provide, for the first time a complete transcriptional and cellular map of a tissue, revealing the heterotypic interactions that define the real nature of a tissue. Perhaps then we could start to appreciate the elegant complexity of the ecosystem that the stem cell and its niche share. I hope SyLeNCe will facilitate the description of novel vulnerabilities that could be explored therapeutically for the treatment of acute myeloid leukaemia having an impact on the quality of life and long-term survival of AML patients.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.

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Koordinator

FUNDACION PARA LA INVESTIGACION MEDICA APLICADA FIMA
Netto-EU-Beitrag
€ 160 932,48
Adresse
AVENIDA DE PIO XII 55
31008 Pamplona
Spanien

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Region
Noreste Comunidad Foral de Navarra Navarra
Aktivitätstyp
Research Organisations
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Gesamtkosten
€ 160 932,48