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Unraveling interaction networks of ammonia- and nitrite-oxidizing microorganisms

Descrizione del progetto

Comprendere meglio la trasformazione dell’azoto per ecosistemi più sani e produttivi

La nitrificazione è il processo mediante il quale l’ammoniaca viene convertita in nitriti e quindi in nitrati. Ciò accade naturalmente nell’ambiente mediante l’azione di batteri specifici. Nella nitrificazione, l’ammoniaca viene prima ossidata in nitriti da batteri ossidanti l’ammoniaca (AOB), e quindi in nitrati da batteri ossidanti nitriti (NOB). Nei terreni fertilizzati, è noto che la nitrificazione provochi danni, mentre nel trattamento biologico delle acque reflue fa il contrario. Il progetto iNet, finanziato dall’UE, inizierà isolando nuove culture di AOB e NOB. Stabilirà quindi i fattori che definiscono le reti di interazione dei nitrificatori e studierà le caratteristiche metaboliche di questa interazione per semplificare le intricate reti di interazione che si verificano in natura. Il progetto fornirà una visione più approfondita della nitrificazione.

Obiettivo

Microbial interactions drive global biogeochemical cycles and shape functionality and productivity of ecosystems. Autotrophic nitrification is a prime example for a mutualistic interplay of two functional groups. In fertilized soils, nitrification contributes to emission of the ozone-depleting greenhouse gas nitrous oxide and nitrogen (N) run-off into surface waters, resulting in eutrophication and algal blooms. In contrast, in biological wastewater treatment it initiates the removal of excess N to reduce the N load into the environment. In their cross-feeding interaction, ammonia-oxidizing bacteria (AOB) provide the electron donor for their partner by converting ammonia to nitrite, which is further oxidized to nitrate by nitrite-oxidizing bacteria (NOB). In addition, nitrifiers also interact with heterotrophic bacteria that feed on metabolites released by nitrifiers or attack them in a predator-prey interaction. In this project, I aim to determine factors defining interaction networks of nitrifiers by analyzing the effect of this interplay on the metabolism of the individual allies and by identifying novel interaction partners of nitrifying microbes. I will analyze the metabolic aspects of this interplay in artificially mixed nitrifying assemblages to simplify the complex interaction networks occurring in nature. Using state-of-the-art isolation techniques, I will first isolate novel AOB and NOB cultures from the same environment to obtain true interaction partners. Physiological key features and gene expression patterns of separately grown and mixed cultures of these isolates will be compared to determine the nature and effects of interactions among nitrifiers. In addition, novel interaction partners of uncultured nitrifiers will be identified by analyzing co-occurrence patterns within spatially structured environments. Overall, this project will greatly expand our understanding of nitrification and the dynamics shaping its stability and process performance.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.

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Meccanismo di finanziamento

MSCA-IF -

Coordinatore

STICHTING RADBOUD UNIVERSITEIT
Contributo netto dell'UE
€ 175 572,48
Indirizzo
HOUTLAAN 4
6525 XZ Nijmegen
Paesi Bassi

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Regione
Oost-Nederland Gelderland Arnhem/Nijmegen
Tipo di attività
Istituti di istruzione secondaria o superiore
Collegamenti
Costo totale
€ 175 572,48