Descrizione del progetto
Conoscenza genomica della sopravvivenza all’aridità
In condizioni di aridità estrema, le proteine sono soggette a un’aggregazione irreversibile, fenomeno noto come essiccamento, che porta alla morte cellulare. Il progetto Desiccation Survival, finanziato dall’UE, sta studiando il ruolo delle proteine citosoliche termosolubili (CAHS, cytosolic abundant heat soluble) nella sopravvivenza dei micro-animali durante i periodi di aridità. Esse rappresentano una famiglia di proteine intrinsecamente disordinate che subiscono una transizione vetrosa per evitare lo spiegamento delle proteine intracellulari. I ricercatori esamineranno le caratteristiche della sequenza necessarie per questa attività protettiva e scopriranno nuove sequenze in grado di salvare le cellule dall’essiccamento. I risultati del progetto forniranno importanti conoscenze sul meccanismo d’azione delle proteine intrinsecamente disordinate e offriranno un paradigma per la progettazione di biomateriali innovativi.
Obiettivo
Desiccation is a form of stress wherein extremely dry conditions cause intracellular proteins to unfold and aggregate irreversibly, resulting in cell-death. How do cells and organisms survive desiccation is a fundamental question in biology. Cytosolic Abundant Heat Soluble (CAHS) proteins, a family of intrinsically disordered proteins (IDPs) in tardigrades (a phylum of micro-animals), have been shown to be important for their survival during long periods of dryness. Under desiccation condition, CAHS proteins undergo glass-transition and gelation to form vitrified solids that protect intracellular proteins from unfolding and aggregation. However, the features of CAHS proteins that confer protection are unknown. Here, I aim to unravel the sequence determinants of CAHS protein functions, by addressing 3 specific questions:
Aim 1: What are the sequence features that promote glass-transition and gelation in CAHS proteins?
Aim 2: Can we discover new sequences that can rescue cells from desiccation?
Aim 3: What is the sequence-to-function paradigm underlying IDP-mediated desiccation survival?
I will (i) perform computational analysis of existing CAHS proteins to extract their sequence features to design a library for adequate sampling of the sequence space; (ii) screen the library with a high-throughput survival-based assay and validate the hits both in vitro and in vivo; (iii) analyse the results with machine learning algorithms to generate characteristic sequence features underlying protective glass-transition. The learned features will be tested by rationally designing and screening a new sequence library for desiccation survival. This project will provide fundamental sequence-level understanding of how IDPs promote stress response, specifically via glass-transition during desiccation. Moreover, the materials and pipeline generated and the findings of this study will aid in engineering functional biomaterials.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine
- ingegneria e tecnologia biotecnologia industriale biomateriale
- scienze naturali informatica e scienze dell'informazione intelligenza artificiale apprendimento automatico
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
PROGRAMMA PRINCIPALE
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H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
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Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
MSCA-IF-EF-ST - Standard EF
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) H2020-MSCA-IF-2018
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Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
SN2 1FL Swindon
Regno Unito
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.