Description du projet
Éliminer la capacité des bactéries à neutraliser les antibiotiques pourrait sonner leur glas
Bien que nous cherchions des solutions pour nous débarrasser des bactéries nocives, ces dernières ont développé des mécanismes pour se débarrasser des antibiotiques «nocifs». Depuis plusieurs décennies, les scientifiques connaissent les pompes d’efflux et leur importance dans la résistance bactérienne aux antibiotiques et dans la résistance des virus, des champignons et des cellules cancéreuses. Ces protéines de transport membranaires expulsent les substances toxiques, dont pratiquement toutes les classes d’antibiotiques pertinentes sur le plan clinique. Certaines d’entre elles éliminent des substrats spécifiques, mais la plupart sont des pompes multirésistantes. Chez certaines bactéries, l’expression des pompes est régulée par le facteur de transcription générale MarA. TaMIE prévoit de concevoir les tout premiers inhibiteurs MarA en utilisant plusieurs voies. Trouver l’inhibiteur MarA pourrait ouvrir la voie à des traitements efficaces qui luttent contre la pharmacorésistance.
Objectif
Antibiotic resistance is a growing global crisis and current predictions suggest that by 2050 drug resistant bacteria will cause up to 10 million deaths a year globally. Bacteria employ many mechanisms to become resistant to antibiotics. One important mechanism is antibiotic efflux where membrane bound efflux pumps actively pump molecules, including antibiotics, out of bacterial cells. The RND-family AcrAB efflux pump confers multi-drug resistance in many Gram-negative bacteria including Escherichia coli and is commonly over-produced in antibiotic resistant clinical isolates. Regulation of RND efflux pump expression is complex but in E. coli the master regulator is the AraC/XylS family global transcription factor MarA. In spite of its relevant role up to now no inhibitor targeting this protein has been published. In this project we aim to develop efflux inhibitors that prevent transcription of acrAB by inhibiting MarA and to test their efficacy by measuring AcrAB expression and activity. In order to design the inhibitors we will analyse MarA structure and its direct DNA interactions based on available crystal structures. We will design oligonucleotides acting as a transcriptional factor decoy that modulate transcription by sequestering MarA from their endogenous DNA binding sites (RO1). We will also design peptides acting as inhibitors by blocking DNA-MarA interactions (RO1). Nextly we will measure the affinity of the inhibitor-MarA complexes by in vitro biochemical assays (RO2) and in vivo experiments (RO3). In RO4, we will crystallize the most promising inhibitor-MarA complexes in order to improve their efficacy after structure analysis. Successful development of these inhibitors will open an avenue in the fight against antibiotic resistance conferred by increased efflux pump activity. Training in efflux pumps to complement her existing skills in protein structure analysis will position the ER as a future research leader in the antibiotic resistance field.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
- ingénierie et technologie ingénierie des materiaux cristaux
- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie bactériologie
- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale pharmacologie et pharmacie produit pharmaceutique antibiotique
- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale pharmacologie et pharmacie résistance aux médicaments résistance multiple aux médicaments
- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale pharmacologie et pharmacie résistance aux médicaments résistance aux antibiotiques
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
PROGRAMME PRINCIPAL
Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme -
H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) H2020-MSCA-IF-2018
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
B15 2TT Birmingham
Royaume-Uni
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.