Projektbeschreibung
Neues über die wichtige Rolle des DEK-Proteins und der Nukleosomen-Kupplungen bei der Tumorregulierung
Das DEK-Protein ist ein Faktor der Chromatinarchitektur, der immer wieder mit Tumorprogression in Verbindung gebracht wurde. Sein Expressionsspiegel fällt bei normalen und Krebszellen unterschiedlich aus, was es zum nützlichen Marker werden lässt. Superauflösende Bildgebung hat kürzlich offenbart, dass Nukleosomen diskrete Gruppen verschiedener Größe und Dichte bilden können, die als Kupplungen bezeichnet werden. Die Verbindung zwischen den DEK-Proteinen und diesen Kupplungen konnte jedoch noch nicht entschlüsselt werden. Das im Rahmen der Marie-Skłodowska-Curie-Maßnahmen finanzierte Projekt qCHROMDEK hat das Ziel, zu einem präzisen quantitativen Verständnis eines möglichen Zusammenhangs zwischen DEK-Expressionsspiegeln und lokalen Chromatinstrukturen zu gelangen. Wissen über die Verknüpfung der DEK-Expression mit der Anzahl der Nukleosomen pro Kupplung könnte das Verständnis der Rolle der Chromatinorganisation auf den verschiedenen Ebenen der Tumorentstehung verbessern.
Ziel
"DEK protein is a chromatin architectural factor which has been consistently associated with tumour progression. Its expression level differs between normal and cancer cells, raising the possibility of using DEK as a tumour marker. On the other hand, super-resolution imaging revealed recently that nucleosomes can form discrete groups called ""clutches"" of various dimensions and densities. However, the quantitative analysis of the connection between proteins playing chromatin architectural role and nucleosome clutches has not been yet deciphered.
Within this project, I hypothesize that there is a correlation between the organisation of DEK oncoprotein and the local chromatin structure related to the proliferation level of cells.
The overall aim of the proposed work is to provide a more precise, quantitative understanding of possible connection between DEK expression level and local chromatin structures and by that to gain the additional information about DEK role in cancer.
This project will take advantage of cutting-edge biophysical tool such as DNA origami, single-molecule localisation microscopy and cellular biology. Experimental design is based on the construction and application of a bi-dimentional DNA origami to calibrate and mimic subnuclear structures. The quantitative approach will rely on STochastic Optical Reconstruction Microscopy (STORM). This study will be done using normal cells with different level of proliferation and cancer cells with different level of malignancy.
Finding the relation between DEK expression, connected to the proliferation level of normal and cancer cells, and the number of nucleosomes per clutch could improve the comprehension of chromatin organisation role in different levels of tumorigenesis. Quantitative insight to the number of nucleosomes per clutch in relation to the level of cell proliferation could be in the future an input for a precise recognition of cancer in the early stage of tumorigenesis.
"
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
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Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
HAUPTPROGRAMM
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H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
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Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
MSCA-IF-EF-ST - Standard EF
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
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(öffnet in neuem Fenster) H2020-MSCA-IF-2018
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Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.
16163 GENOVA
Italien
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.