Description du projet
Une méthode de spectroscopie rapide pour détecter les mutations
Le séquençage de l’ADN et la PCR comprennent les méthodes de référence absolue pour identifier les mutations génétiques. Toutefois, la recherche continue pour trouver des techniques rapides, bon marché et précises afin de détecter les mutations au niveau moléculaire. Le projet 2D-MES, financé par l’UE, propose de détecter les mutations de base dans l’ADN ou l’ARN en utilisant des biocapteurs à base de graphène. Les molécules testées sont attachées à un nanoruban de graphène (NRG) dans un environnement aqueux, et leurs caractéristiques de transport sont enregistrées. Les empreintes moléculaires du transport de l’ADN/ARN muté obtenues sur le NRG serviront à développer un outil innovant doté d’une résolution spatiale élevée.
Objectif
In this project, Dr. Reza Rezapour will address, by a combination of quantum mechanical and classical simulations combined with electronic transport techniques, the sensing capabilities of graphene-based biosensors to identify DNA and RNA mutations in PNA-functionalized graphene nanoribbons.
In the search for fast, inexpensive and accurate tools for DNA sequencing and mutation recognition, computational techniques are being fruitfully used to address detection at the molecular level. We will extended the 2D-MES method previously developed by Dr. Rezapour to the identification, not only of single normal and mutated nucleobases on graphene, but of base mutations in DNA or RNA fragments attached to a graphene nanoribbon (GNR) in an aqueous environment. To this aim, after the quantum mechanical (QM) calculation of the transport characteristics of a nucleobases-GNR system in vacuum, we will study: (1) large DNA/RNA fragments in a solvent by molecular mechanics (MM) classical methods (to study mutation stability in a given sequence) and (2) the most stable mutations on a GNR by novel hybrid QM/MM simulations combining the accuracy of QM with the speed of MM.
Besides providing new insight on fundamental aspects of physical processes at the interface between solids, liquids and biomolecules, the project will train Dr. Rezapour in advanced new techniques, complementary to his current expertise; and it will provide the community with a new and efficient QM/MM-electronic transport tool by the implementation of transport routines into the existent QM/MM package. The obtained QM/MM transport molecular fingerprints of the mutated DNA/RNA on the GNR will serve as a proof-of-concept for the design of a graphene-based bionsensor fast, inexpensive, and with high spatial resolution.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ADN
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule
- sciences naturelles sciences biologiques génétique mutation
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ARN
- sciences naturelles sciences physiques optique spectroscopie
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
PROGRAMME PRINCIPAL
Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme -
H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) H2020-MSCA-IF-2018
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
18071 GRANADA
Espagne
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.