Descrizione del progetto
Un metodo di spettroscopia veloce per il rilevamento delle mutazioni
Il sequenziamento del DNA e la PCR costituiscono i metodi standard di riferimento per l’identificazione delle mutazioni genetiche. Tuttavia, vi è una costante ricerca di tecniche veloci, poco costose e accurate per rilevare le mutazioni a livello molecolare. Il progetto 2D-MES, finanziato dall’UE, propone di rilevare mutazioni di base nel DNA o nell’RNA usando biosensori basati sul grafene. Le molecole in esame sono fissate a un nanonastro di grafene in un ambiente acquoso, mentre le loro caratteristiche di trasporto vengono registrate. Le impronte molecolari relative al trasporto lasciate sul nanonastro dal DNA/RNA mutato getteranno le basi per lo sviluppo di uno strumento innovativo ad alta risoluzione spaziale.
Obiettivo
In this project, Dr. Reza Rezapour will address, by a combination of quantum mechanical and classical simulations combined with electronic transport techniques, the sensing capabilities of graphene-based biosensors to identify DNA and RNA mutations in PNA-functionalized graphene nanoribbons.
In the search for fast, inexpensive and accurate tools for DNA sequencing and mutation recognition, computational techniques are being fruitfully used to address detection at the molecular level. We will extended the 2D-MES method previously developed by Dr. Rezapour to the identification, not only of single normal and mutated nucleobases on graphene, but of base mutations in DNA or RNA fragments attached to a graphene nanoribbon (GNR) in an aqueous environment. To this aim, after the quantum mechanical (QM) calculation of the transport characteristics of a nucleobases-GNR system in vacuum, we will study: (1) large DNA/RNA fragments in a solvent by molecular mechanics (MM) classical methods (to study mutation stability in a given sequence) and (2) the most stable mutations on a GNR by novel hybrid QM/MM simulations combining the accuracy of QM with the speed of MM.
Besides providing new insight on fundamental aspects of physical processes at the interface between solids, liquids and biomolecules, the project will train Dr. Rezapour in advanced new techniques, complementary to his current expertise; and it will provide the community with a new and efficient QM/MM-electronic transport tool by the implementation of transport routines into the existent QM/MM package. The obtained QM/MM transport molecular fingerprints of the mutated DNA/RNA on the GNR will serve as a proof-of-concept for the design of a graphene-based bionsensor fast, inexpensive, and with high spatial resolution.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali scienze biologiche genetica DNA
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole
- scienze naturali scienze biologiche genetica mutazione
- scienze naturali scienze biologiche genetica RNA
- scienze naturali scienze fisiche ottica spettroscopia
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Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
PROGRAMMA PRINCIPALE
Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo programma -
H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
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Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) H2020-MSCA-IF-2018
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Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
18071 GRANADA
Spagna
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.