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A Multi-omics Approach To Decode Epigenetic Lesions In Pancreatic Cancer Development

Description du projet

Le rôle des mutations épigénétiques dans le cancer du pancréas

La chromatine est une macromolécule constituée d’ADN enroulé autour de protéines histones, permettant aux facteurs de transcription, aux voies de signalisation et aux stimulations mécaniques de réguler l’expression génétique. Les mécanismes épigénétiques qui altèrent les phénotypes sans modifier la séquence d’ADN permettent des changements réversibles dans la régulation des gènes. Ces aberrations dans la régulation de la chromatine sont associées à un large éventail de maladies, dont le cancer. Le projet MultiPan, financé par l’UE, vise à étudier les mutations épigénétiques dans le cancer du pancréas, une maladie mortelle au pronostic sombre en passe de devenir la deuxième cause de décès associé au cancer au cours de la prochaine décennie. Ce projet fournira une étude complète des lésions épigénétiques survenant au cours du développement du cancer et des mécanismes de dérégulation des gènes sous‑jacents.

Objectif

Chromatin, the complex structured macromolecule consisting of DNA wrapped around histones, represents the ground where transcription factors, signalling pathways and mechanical stimulations converge to regulate gene expression and determine cellular phenotypes. Epigenetic mechanisms altering these phenotypes without modifying the DNA sequence are extremely pliable and allow for subtle and reversible changes in gene regulation. Consequently, aberrations in chromatin regulation are associated with a wide range of diseases, such as cancer, where they can be pivotal for the fitness and activity of malignant cells.
Here we aim to investigate the role played by epigenetic mutations in pancreatic cancer, a dismal disease with poor prognosis and projected to be the second most common cause of cancer-related death in the next decade. The candidate will apply cutting-edge technologies such as parallel single-cell RNA-seq and single-nucleus ATAC-seq to uncover the correlation between changes in chromatin accessibility and gene expression in patient-derived and engineered 3D organoid models. These findings will constitute the basis for functional validations that will involve the combination of epigenomic tools (dCas9-mediated epigenetic modifications) and high-resolution imaging approaches (light-sheet microscopy). Therefore, this project will provide a comprehensive view of the epigenetic lesions occurring during cancer development, shedding light on mechanisms of gene de-regulation and paving the way to novel approaches to cancer treatment.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

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Régime de financement

MSCA-IF-EF-ST - Standard EF

Coordinateur

CHARITE - UNIVERSITAETSMEDIZIN BERLIN
Contribution nette de l'UE
€ 162 806,40
Adresse
Chariteplatz 1
10117 Berlin
Allemagne

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Région
Berlin Berlin Berlin
Type d’activité
Higher or Secondary Education Establishments
Liens
Coût total
€ 162 806,40