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A Multi-omics Approach To Decode Epigenetic Lesions In Pancreatic Cancer Development

Descrizione del progetto

Il ruolo delle mutazioni epigenetiche nel cancro al pancreas

La cromatina è una macromolecola costituita da DNA avvolto intorno a proteine istoniche che consente la regolazione dell’espressione genica mediante fattori di trascrizione, vie di segnalazione e stimoli meccanici. I meccanismi epigenetici che modificano i fenotipi senza alterare la sequenza di DNA consentono di effettuare cambiamenti reversibili nella regolazione genica. Queste aberrazioni nella regolazione della cromatina sono associate a una vasta gamma di malattie, tra cui il cancro. Il progetto MultiPan, finanziato dall’UE, si prefigge di studiare le mutazioni epigenetiche nel cancro al pancreas, una malattia letale caratterizzata da una prognosi sfavorevole che, secondo le previsioni, diventerà la seconda causa più comune di decessi per cancro nel prossimo decennio. Questo progetto effettuerà un’indagine approfondita sulle lesioni epigenetiche che si verificano nel corso dello sviluppo del cancro, oltre che sui meccanismi relativi alla deregolazione genica che le provocano.

Obiettivo

Chromatin, the complex structured macromolecule consisting of DNA wrapped around histones, represents the ground where transcription factors, signalling pathways and mechanical stimulations converge to regulate gene expression and determine cellular phenotypes. Epigenetic mechanisms altering these phenotypes without modifying the DNA sequence are extremely pliable and allow for subtle and reversible changes in gene regulation. Consequently, aberrations in chromatin regulation are associated with a wide range of diseases, such as cancer, where they can be pivotal for the fitness and activity of malignant cells.
Here we aim to investigate the role played by epigenetic mutations in pancreatic cancer, a dismal disease with poor prognosis and projected to be the second most common cause of cancer-related death in the next decade. The candidate will apply cutting-edge technologies such as parallel single-cell RNA-seq and single-nucleus ATAC-seq to uncover the correlation between changes in chromatin accessibility and gene expression in patient-derived and engineered 3D organoid models. These findings will constitute the basis for functional validations that will involve the combination of epigenomic tools (dCas9-mediated epigenetic modifications) and high-resolution imaging approaches (light-sheet microscopy). Therefore, this project will provide a comprehensive view of the epigenetic lesions occurring during cancer development, shedding light on mechanisms of gene de-regulation and paving the way to novel approaches to cancer treatment.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

Programma(i)

Argomento(i)

Meccanismo di finanziamento

MSCA-IF-EF-ST - Standard EF

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Invito a presentare proposte

(si apre in una nuova finestra) H2020-MSCA-IF-2018

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Coordinatore

CHARITE - UNIVERSITAETSMEDIZIN BERLIN
Contributo netto dell'UE
€ 162 806,40
Indirizzo
Chariteplatz 1
10117 Berlin
Germania
Regione
Berlin Berlin Berlin
Tipo di attività
Higher or Secondary Education Establishments
Collegamenti
Costo totale
€ 162 806,40