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CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
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Predicting of Prokaryotic Defence Distributions

Description du projet

Disséquer l’immunité bactérienne

Pour échapper à l’infection par des virus (bactériophages), les bactéries ont développé une batterie de mécanismes de défense. L’objectif principal du projet PredProkDef, financé par l’UE, est de comprendre quand les bactéries utilisent chaque stratégie. Les chercheurs suivront une approche multidisciplinaire comprenant des techniques d’écologie et de métagénomique pour étudier l’immunité microbienne. L’importance de ces connaissances est double puisqu’elles peuvent être employées pour protéger les bactéries utilisées dans les applications biotechnologiques par exemple. Dans le même temps, les bactériophages représentent une avenue thérapeutique pour surmonter la crise actuelle de résistance aux antibiotiques. Les informations générées pourraient donc être exploitées comme stratégie antimicrobienne.

Objectif

Bacteria are crucial for health, nutrient cycling and biotechnology but face a constant pressure from the viruses that infect them (phages). As such, bacteria have evolved a sophisticated suite of defence mechanisms that allow them to evade phages. These defence mechanisms can be classified into two basic classes: selfish or altruistic. A selfish system protects individuals, whereas an altruistic system protects the population. Interestingly, the distribution of this defensive arsenal is uneven, with large variations in the types carried, even among closely related species. This proposal aims to understand the basis of this distribution by using a multi-disciplinary approach that combines the precision of a model laboratory system with cutting-edge metagenomics techniques.

Specifically, I will use abortive infection as a model for altruistic defence and CRISPR as a model for selfish defence and test the role of spatial structure in determining the abundance of each type. High spatial structure is predicted to be a key determinant of altruistic defences as it results in proximate bacteria being closely related. I will then apply the findings from the first objectives to classify a novel, recently discovered, defence system. Together, these results will enable researchers to better understand microbial immunity, with key consequences for industry and healthcare.

The outgoing phase will take place at the University of Otago, New Zealand, using molecular biology expertise in abortive infection and CRISPR systems. The return phase will take place at the University of Exeter, UK, benefitting from expertise in ecology and evolution. The proposed project will allow me to complement my strong background in genomics and ecology with molecular biology and novel bioinformatic approaches. By working in two world-class research laboratories I will further develop independence and a strong collaborative network for the future.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)

Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme de financement

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) H2020-MSCA-IF-2018

Voir tous les projets financés au titre de cet appel

Coordinateur

THE UNIVERSITY OF EXETER
Contribution nette de l'UE

La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.

€ 272 084,16
Adresse
THE QUEEN'S DRIVE NORTHCOTE HOUSE
EX4 4QJ Exeter
Royaume-Uni

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Région
South West (England) Devon Devon CC
Type d’activité
Higher or Secondary Education Establishments
Liens
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

€ 272 084,16

Partenaires (1)

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