Skip to main content
Przejdź do strony domowej Komisji Europejskiej (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
polski pl
CORDIS - Wyniki badań wspieranych przez UE
CORDIS

Predicting of Prokaryotic Defence Distributions

Opis projektu

Badanie odporności bakterii

Aby uniknąć zakażenia przez wirusy (bakteriofagi), bakterie wykształciły szereg mechanizmów obronnych. Głównym celem finansowanego przez UE projektu PredProkDef jest ustalenie, kiedy bakterie stosują poszczególne strategie. Uczeni zastosują podejście multidyscyplinarne, obejmujące techniki z zakresu ekologii i metagenomiki, w celu zbadania odporności drobnoustrojów. Wiedzę tę może będzie wykorzystać także do ochrony bakterii stosowanych np. w biotechnologii. Jednocześnie bakteriofagi mogą stanowić rozwiązanie obecnego kryzysu związanego z opornością na antybiotyki, a informacje zgromadzone w toku omawianego badania można wykorzystać jako strategię przeciwdrobnoustrojową.

Cel

Bacteria are crucial for health, nutrient cycling and biotechnology but face a constant pressure from the viruses that infect them (phages). As such, bacteria have evolved a sophisticated suite of defence mechanisms that allow them to evade phages. These defence mechanisms can be classified into two basic classes: selfish or altruistic. A selfish system protects individuals, whereas an altruistic system protects the population. Interestingly, the distribution of this defensive arsenal is uneven, with large variations in the types carried, even among closely related species. This proposal aims to understand the basis of this distribution by using a multi-disciplinary approach that combines the precision of a model laboratory system with cutting-edge metagenomics techniques.

Specifically, I will use abortive infection as a model for altruistic defence and CRISPR as a model for selfish defence and test the role of spatial structure in determining the abundance of each type. High spatial structure is predicted to be a key determinant of altruistic defences as it results in proximate bacteria being closely related. I will then apply the findings from the first objectives to classify a novel, recently discovered, defence system. Together, these results will enable researchers to better understand microbial immunity, with key consequences for industry and healthcare.

The outgoing phase will take place at the University of Otago, New Zealand, using molecular biology expertise in abortive infection and CRISPR systems. The return phase will take place at the University of Exeter, UK, benefitting from expertise in ecology and evolution. The proposed project will allow me to complement my strong background in genomics and ecology with molecular biology and novel bioinformatic approaches. By working in two world-class research laboratories I will further develop independence and a strong collaborative network for the future.

Dziedzina nauki (EuroSciVoc)

Program(-y)

Temat(-y)

System finansowania

MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania

Zaproszenie do składania wniosków

(odnośnik otworzy się w nowym oknie) H2020-MSCA-IF-2018

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszenia

Koordynator

THE UNIVERSITY OF EXETER
Wkład UE netto
€ 272 084,16
Adres
THE QUEEN'S DRIVE NORTHCOTE HOUSE
EX4 4QJ Exeter
Zjednoczone Królestwo
Region
South West (England) Devon Devon CC
Rodzaj działalności
Higher or Secondary Education Establishments
Linki
Koszt całkowity
€ 272 084,16

Partnerzy (1)