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Laboratory Evolution of Virus-likE pRotein cAGes for Eukaryotic mRNA delivery

Description du projet

Des prisons à bactéries pour délivrer des ARNm dans les cellules

La thérapie génique constitue une approche prometteuse pour traiter de nombreuses maladies génétiques, mais elle nécessite d’injecter des acides nucléiques dans les cellules, une tâche qui s’est révélée particulièrement complexe. Le projet LEVERAGE mRNA, financé par l’UE, propose le développement de conteneurs vides à base de protéines pour administrer des molécules ARN, imitant ainsi la structure des virus. Les chercheurs utiliseront la synthase lumazine, une protéine bactérienne connue pour former des nanocompartiments symétriques qui peuvent se désassembler au sein des cellules de mammifères et libérer les molécules ARN encapsulées dans le cytosol. L’approche de LEVERAGE mRNA offre une stratégie prometteuse pour administrer des molécules ARNm visant à remplacer des protéines manquantes ou dysfonctionnelles, telles que les thérapies de remplacement enzymatique, impliquant des avantages évidents pour la santé humaine.

Objectif

Nucleic acids are promising candidates for treating disease by stimulating, inhibiting, or replacing other nucleic acids or proteins inside of eukaryotic cells—a process known as “gene therapy.” However, methods to efficiently and safely deliver genes into cells are still lacking. The problem is that nucleic acids are not cell permeant and degrade before reaching the cytosol. One way to transport oligonucleotides into cells is by packaging them into hollow containers made of proteins, a method that has been successfully hijacked by viruses for a long time.

Here, we propose to design and engineer an artificial proteinaceous container that (1) selectively encapsulates ribonucleic acids (RNAs) using a known RNA recognition tag and (2) delivers this RNA into the cytosol of mammalian cells. Protein engineering, which embodies both rational design and computational modeling, will be used to create the starting design of this artificial protein container. The initial design will be based on the protein lumazine synthase from the bacterial organism Aquifex aeolicus (AaLS), which forms small but highly symmetrical nanocompartments in bacteria and is very tolerant to genetic changes. To optimize this design, we will use directed evolution to induce an artificial selection pressure on a large population of distinct capsid variants, allowing us to obtain only the best-performing capsid variants: those that can enter and disassemble selectively inside of mammalian cells, thereby releasing the enclosed RNA molecules into the cytosol. New AaLS containers will be thoroughly characterized using cutting-edge technologies, such next-generation sequencing and cryo-electron microscopy.

The ultimate goal of LEVERAGE mRNA is to use the designed and evolved capsids to deliver messenger RNAs (mRNAs) into cells that encode missing or dysfunctional proteins, for example in enzyme replacement therapies. If successful, this action will have lasting positive impacts on human health.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.

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Régime de financement

MSCA-IF-EF-ST - Standard EF

Coordinateur

EIDGENOESSISCHE TECHNISCHE HOCHSCHULE ZUERICH
Contribution nette de l'UE
€ 191 149,44
Adresse
Raemistrasse 101
8092 Zuerich
Suisse

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Région
Schweiz/Suisse/Svizzera Zürich Zürich
Type d’activité
Higher or Secondary Education Establishments
Liens
Coût total
€ 191 149,44