Descripción del proyecto
Información sobre la evolución de la poliploidía en la avena
La poliploidía en los cultivos se asocia con una mejor adecuación, lo que a menudo permite que las plantas se adapten a una gama más amplia de hábitats y sobrevivan en climas inestables mejor que sus progenitores diploides. Los científicos del proyecto financiado con fondos europeos OCHRE se proponen desentrañar la función de las translocaciones cromosómicas intergenómicas en la evolución de las especies poliploides en la avena. La hipótesis de trabajo es que las translocaciones entre los genomas de la avena guardan relación con la actividad de los elementos transponibles, así como con los cambios en la metilación del ADN y las modificaciones de las histonas. OCHRE aplicará un análisis de citogenética, bioinformática y epigenética del genoma de la avena para revelar los posibles mecanismos implicados en las translocaciones intergenómicas.
Objetivo
Comparative genetic analysis of grasses, one of the most widely distributed plant families and including the three most important human foods, has demonstrated that different groups differ in the evolutionary presence of intergenomic chromosome translocations in polyploid species, including the important crops. The overall goal of our research group is to define the nature and mechanism of terminal intergenomic translocations in oats (Avena) where these are frequent, allowing us to model their contribution to cereal genome evolution. We hypothesize that terminal translocations between oat genomes are related to transposable element activity, a decrease in DNA methylation, and histone modifications that are differential between the genomes. We propose a focused series of complementary molecular cytogenetic, bioinformatic, and epigenetic studies on oat and wheat genomes to characterize this physical genome rearrangement process. A comprehensive model illustrating the potential mechanisms involved in terminal intergenomic translocations will be elucidated by the simultaneous hybridization with the use of genome-specific probes and retrotransposon sequences, and immunostaining of histones and 5-methylcytosine in mitotic cells. The research will reveal why genomes of oats show frequent intergenomic translocations, playing a significant role in their evolution, in contrast to wheats where the translocations are rare. The fundamental research has implications for breeding oats to exploit biodiversity through introgression from wild species, and perhaps enabling additional introgressions in wheat breeding.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural.
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Programa(s)
Régimen de financiación
MSCA-IF-EF-ST - Standard EFCoordinador
LE1 7RH Leicester
Reino Unido