Opis projektu
Badanie ewolucji poliploidalności owsa
Poliploidalność roślin uprawnych wiąże się z ich zwiększoną odpornością, dzięki której często są w stanie dostosowywać się do różnych siedlisk oraz funkcjonować w niestabilnych warunkach klimatycznych lepiej niż ich diploidalni przodkowie. Skupieni wokół finansowanego ze środków UE projektu OCHRE naukowcy zamierzają odkryć rolę, jaką międzygenomowe translokacje chromosomów odegrały w ewolucji poliploidalnych gatunków owsa. Robocza hipoteza zakłada, że translokacje między genomami owsa są powiązane z aktywnością transpozonów, zmianami w metylacji DNA oraz modyfikacjami histonów. Zespół projektu OCHRE przeprowadzi cytogenetyczną, bioinformatyczną i epigenetyczną analizę genomu owsa, by odkryć potencjalne mechanizmy związane z translokacjami międzygenomowymi.
Cel
Comparative genetic analysis of grasses, one of the most widely distributed plant families and including the three most important human foods, has demonstrated that different groups differ in the evolutionary presence of intergenomic chromosome translocations in polyploid species, including the important crops. The overall goal of our research group is to define the nature and mechanism of terminal intergenomic translocations in oats (Avena) where these are frequent, allowing us to model their contribution to cereal genome evolution. We hypothesize that terminal translocations between oat genomes are related to transposable element activity, a decrease in DNA methylation, and histone modifications that are differential between the genomes. We propose a focused series of complementary molecular cytogenetic, bioinformatic, and epigenetic studies on oat and wheat genomes to characterize this physical genome rearrangement process. A comprehensive model illustrating the potential mechanisms involved in terminal intergenomic translocations will be elucidated by the simultaneous hybridization with the use of genome-specific probes and retrotransposon sequences, and immunostaining of histones and 5-methylcytosine in mitotic cells. The research will reveal why genomes of oats show frequent intergenomic translocations, playing a significant role in their evolution, in contrast to wheats where the translocations are rare. The fundamental research has implications for breeding oats to exploit biodiversity through introgression from wild species, and perhaps enabling additional introgressions in wheat breeding.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
- nauki przyrodniczenauki biologicznegenetykaDNA
- nauki przyrodniczenauki biologiczneekologiaekosystemy
- nauki przyrodniczenauki biologicznegenetykachromosomy
- nauki przyrodniczenauki biologicznegenetykagenom
- nauki rolniczerolnictwo, leśnictwo i rybołówstworolnictwoziarna i nasiona oleistezboża
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Program(-y)
Temat(-y)
System finansowania
MSCA-IF-EF-ST - Standard EFKoordynator
LE1 7RH Leicester
Zjednoczone Królestwo