Description du projet
Comprendre l’évolution de la polyploïdie de l’avoine
La polyploïdie des cultures est associée à une meilleure santé, permettant aux plantes de s’adapter à un plus large éventail d’habitats et de mieux survivre dans des climats instables par rapport à leurs progéniteurs diploïdes. Les scientifiques du projet OCHRE, financé par l’UE, souhaitent découvrir le rôle des translocations chromosomiques intergénomiques dans l’évolution des espèces polyploïdiques de l’avoine. L’hypothèse de travail est que les translocations entre les génomes de l’avoine sont liées à une activité des éléments transposables ainsi qu’à des changements de la méthylation de l’ADN et à des modifications d’histone. OCRE suivra une analyse cytogénétique, bioinformatique et épigénétique du génome de l’avoine pour découvrir les mécanismes potentiels impliqués dans les translocations intergénomiques.
Objectif
Comparative genetic analysis of grasses, one of the most widely distributed plant families and including the three most important human foods, has demonstrated that different groups differ in the evolutionary presence of intergenomic chromosome translocations in polyploid species, including the important crops. The overall goal of our research group is to define the nature and mechanism of terminal intergenomic translocations in oats (Avena) where these are frequent, allowing us to model their contribution to cereal genome evolution. We hypothesize that terminal translocations between oat genomes are related to transposable element activity, a decrease in DNA methylation, and histone modifications that are differential between the genomes. We propose a focused series of complementary molecular cytogenetic, bioinformatic, and epigenetic studies on oat and wheat genomes to characterize this physical genome rearrangement process. A comprehensive model illustrating the potential mechanisms involved in terminal intergenomic translocations will be elucidated by the simultaneous hybridization with the use of genome-specific probes and retrotransposon sequences, and immunostaining of histones and 5-methylcytosine in mitotic cells. The research will reveal why genomes of oats show frequent intergenomic translocations, playing a significant role in their evolution, in contrast to wheats where the translocations are rare. The fundamental research has implications for breeding oats to exploit biodiversity through introgression from wild species, and perhaps enabling additional introgressions in wheat breeding.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
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- sciences naturellessciences biologiquesgénétiqueADN
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LE1 7RH Leicester
Royaume-Uni