Descripción del proyecto
Una plataforma innovadora para el diseño de ligandos altamente selectivos
El desarrollo de ligandos con alta especificidad contra una diana concreta posee un enorme interés para la biotecnología y la terapéutica. Sin embargo, la producción de ligandos de alta afinidad que tengan como diana muchos epítopos de una sola molécula supone todo un desafío. El proyecto APTAFRAME, financiado con fondos europeos, desarrolló una plataforma nueva para el descubrimiento de anticuerpos y nucleótidos aptámeros o péptidos que se unan a moléculas específicas. Esta plataforma combina estructuras de «papiroflexia» del ADN a modo de marcos moleculares tridimensionales con retroalimentación estructural de reconstrucciones mediante microscopía crioelectrónica para ayudar a diseñar ligandos cooperativos que reconozcan dianas altamente específicas. Se espera que la plataforma APTAFRAME encuentre aplicación en el desarrollo de biosensores, análisis y diagnóstico de proteomas.
Objetivo
Affinity reagents such as antibodies and aptamers are of paramount importance as tools in biotechnology and the treatment of a wide range of diseases. However, despite their scientific and economAffinity reagents such as antibodies and aptamers are of paramount importance as tools in biotechnology and the treatment of a wide range of diseases. However, despite their scientific and economic impact it remains challenging to systematically generate high-affinity ligands to cover all epitopes of a given target. Here I propose a strategy to provide spatial control over ligand discovery process leveraging the power of in vitro evolution in conjunction with the spatial addressability of DNA nanotechnology methods. Together they form a new discovery platform for the systematic and parallel generation of ligands, specifically aptamers and single-chain Fv antibody fragments (scFv), to provide coverage of epitopes at predefined targets. The proposed strategy exploits cooperative binding (avidity), by co-evolution of the affinity reagents, in the context of a defined molecular three-dimensional framework provided by DNA origami structures. This further expedites structure determination of ligand-target complexes by cryo-electron microscopy (cryo-EM). The combination of rational framework design, in vitro evolution and structural feedback provided by cryo-EM reconstructions will provide a toolbox for the systematic generation of ligands to all accessible epitopes. Our approach also provides a tool for electron microscopy reconstruction of smaller (< 100kDa) biomolecules and their molecular interactions by enhancing contrast and providing context. Once established, this approach will provide a transformational technology platform that enables the parallel interrogation of multidimensional, spatially resolved libraries, yielding cooperative ligands for highly specific target recognition, with direct applications in biosensor development, proteome analysis, diagnostics and therapy.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas proteínas proteómica
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ADN
- ciencias naturales ciencias biológicas biología evolutiva
- ingeniería y tecnología nanotecnología
- ciencias naturales ciencias físicas óptica microscopía electron microscopy
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
PROGRAMA PRINCIPAL
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H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
MSCA-IF-EF-RI - RI – Reintegration panel
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
(se abrirá en una nueva ventana) H2020-MSCA-IF-2018
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
SN2 1FL SWINDON
Reino Unido
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.