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CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
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DNA-origami frame platform for co-evolution ligand selection

Description du projet

Une plateforme innovante pour la conception de ligands hautement sélectifs

Le développement de ligands à haute spécificité contre une cible particulière présente un intérêt particulier pour la biotechnologie et la thérapeutique. Cependant, la production de ligands de haute affinité ciblant de nombreux épitopes d’une seule molécule représente un défi. Le projet APTAFRAME, financé par l’UE, a développé une nouvelle plateforme pour la découverte d’anticorps et de nucléotides ou peptides aptamères qui se lient à des molécules spécifiques. Cette plateforme combine des structures d’ADN en origami comme des cadres 3D moléculaires avec une rétroaction structurelle des reconstructions par cryomicroscopie électronique pour contribuer à la conception de ligands coopératifs pour la reconnaissance de cibles hautement spécifiques. La plateforme APTAFRAME devrait trouver une application dans le développement de biocapteurs, l’analyse du protéome et le diagnostic.

Objectif

Affinity reagents such as antibodies and aptamers are of paramount importance as tools in biotechnology and the treatment of a wide range of diseases. However, despite their scientific and economAffinity reagents such as antibodies and aptamers are of paramount importance as tools in biotechnology and the treatment of a wide range of diseases. However, despite their scientific and economic impact it remains challenging to systematically generate high-affinity ligands to cover all epitopes of a given target. Here I propose a strategy to provide spatial control over ligand discovery process leveraging the power of in vitro evolution in conjunction with the spatial addressability of DNA nanotechnology methods. Together they form a new discovery platform for the systematic and parallel generation of ligands, specifically aptamers and single-chain Fv antibody fragments (scFv), to provide coverage of epitopes at predefined targets. The proposed strategy exploits cooperative binding (avidity), by co-evolution of the affinity reagents, in the context of a defined molecular three-dimensional framework provided by DNA origami structures. This further expedites structure determination of ligand-target complexes by cryo-electron microscopy (cryo-EM). The combination of rational framework design, in vitro evolution and structural feedback provided by cryo-EM reconstructions will provide a toolbox for the systematic generation of ligands to all accessible epitopes. Our approach also provides a tool for electron microscopy reconstruction of smaller (< 100kDa) biomolecules and their molecular interactions by enhancing contrast and providing context. Once established, this approach will provide a transformational technology platform that enables the parallel interrogation of multidimensional, spatially resolved libraries, yielding cooperative ligands for highly specific target recognition, with direct applications in biosensor development, proteome analysis, diagnostics and therapy.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

MSCA-IF-EF-RI - RI – Reintegration panel

Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme de financement

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) H2020-MSCA-IF-2018

Voir tous les projets financés au titre de cet appel

Coordinateur

UNITED KINGDOM RESEARCH AND INNOVATION
Contribution nette de l'UE

La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.

€ 212 933,76
Adresse
POLARIS HOUSE NORTH STAR AVENUE
SN2 1FL SWINDON
Royaume-Uni

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Région
South West (England) Gloucestershire, Wiltshire and Bristol/Bath area Swindon
Type d’activité
Research Organisations
Liens
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

€ 212 933,76
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