Opis projektu
Innowacyjna platforma do projektowania wysoce selektywnych ligandów
Stworzenie ligandów o wysokiej specyficzności w odniesieniu do określonego celu jest zagadnieniem szczególnie ważnym dla biotechnologii i farmakologii, jednak uzyskanie ligandów o wysokim powinowactwie, które będą w stanie działać na wiele epitopów pojedynczej molekuły jest dużym wyzwaniem. W związku z tym badacze z finansowanego ze środków UE projektu APTAFRAME opracowali nową platformę na potrzeby odkrywania przeciwciał i aptamerowych nukleotydów lub peptydów, które wiążą się z określonymi cząsteczkami. Taka platforma łączy struktury origami w DNA jako molekularne ramy 3D ze strukturalnymi informacjami zwrotnymi z rekonstrukcjami uzyskanymi metodą mikroskopii krioelektronowej. Połączenie to pomoże w opracowaniu współpracujących ligandów zdolnych do rozpoznawania wysoce specyficznych celów. Przewiduje się, że platforma APTAFRAME znajdzie zastosowanie w opracowywaniu bioczujników, analizie proteomu oraz diagnostyce.
Cel
Affinity reagents such as antibodies and aptamers are of paramount importance as tools in biotechnology and the treatment of a wide range of diseases. However, despite their scientific and economAffinity reagents such as antibodies and aptamers are of paramount importance as tools in biotechnology and the treatment of a wide range of diseases. However, despite their scientific and economic impact it remains challenging to systematically generate high-affinity ligands to cover all epitopes of a given target. Here I propose a strategy to provide spatial control over ligand discovery process leveraging the power of in vitro evolution in conjunction with the spatial addressability of DNA nanotechnology methods. Together they form a new discovery platform for the systematic and parallel generation of ligands, specifically aptamers and single-chain Fv antibody fragments (scFv), to provide coverage of epitopes at predefined targets. The proposed strategy exploits cooperative binding (avidity), by co-evolution of the affinity reagents, in the context of a defined molecular three-dimensional framework provided by DNA origami structures. This further expedites structure determination of ligand-target complexes by cryo-electron microscopy (cryo-EM). The combination of rational framework design, in vitro evolution and structural feedback provided by cryo-EM reconstructions will provide a toolbox for the systematic generation of ligands to all accessible epitopes. Our approach also provides a tool for electron microscopy reconstruction of smaller (< 100kDa) biomolecules and their molecular interactions by enhancing contrast and providing context. Once established, this approach will provide a transformational technology platform that enables the parallel interrogation of multidimensional, spatially resolved libraries, yielding cooperative ligands for highly specific target recognition, with direct applications in biosensor development, proteome analysis, diagnostics and therapy.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne biochemia biocząsteczki białka proteomika
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka DNA
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne biologia ewolucyjna
- inżynieria i technologia nanotechnologia
- nauki przyrodnicze nauki fizyczne optyka mikroskopia electron microscopy
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Przepraszamy… podczas wykonywania operacji wystąpił nieoczekiwany błąd.
Wymagane uwierzytelnienie. Powodem może być wygaśnięcie sesji.
Dziękujemy za przesłanie opinii. Wkrótce otrzymasz wiadomość e-mail z potwierdzeniem zgłoszenia. W przypadku wybrania opcji otrzymywania powiadomień o statusie zgłoszenia, skontaktujemy się również gdy status ulegnie zmianie.
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
-
H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
GŁÓWNY PROGRAM
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu -
H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
MSCA-IF-EF-RI - RI – Reintegration panel
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
(odnośnik otworzy się w nowym oknie) H2020-MSCA-IF-2018
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszeniaKoordynator
Kwota netto dofinansowania ze środków Unii Europejskiej. Suma środków otrzymanych przez uczestnika, pomniejszona o kwotę unijnego dofinansowania przekazanego powiązanym podmiotom zewnętrznym. Uwzględnia podział unijnego dofinansowania pomiędzy bezpośrednich beneficjentów projektu i pozostałych uczestników, w tym podmioty zewnętrzne.
SN2 1FL SWINDON
Zjednoczone Królestwo
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.