Description du projet
Les décalages ribosomiques comme régulateurs de stress du pool d’ARNm cellulaire
La modulation de l’expression génétique maintient l’homéostasie cellulaire, impliquant les processus de la transcription et de la dégradation de l’ARN pour déterminer l’abondance et la composition du pool d’ARNm. La dégradation des ARNm non-sens (NMD) contrôle le renouvellement de l’ARN, éliminant les transcriptions erronées contenant des codons de terminaison prématurés (PTC). De récentes études montrent que les décalages ribosomiques (DR), survenant durant la traduction, induisent des PTC et initient une réponse NMD. Les premières données indiquent que le stress régule les DR et représente un nouveau mécanisme pour détecter les signaux environnementaux et ajuster l’abondance de l’ARNm. Le projet TERMINATOR, financé par l’UE, examine la régulation dépendante du stress des DR et leur rôle dans le renouvellement de l’ARN, appliquant une analyse à grande échelle dans la levure et les cellules humaines.
Objectif
Modulation of gene expression is key for maintaining cellular homeostasis in the changing environment. It is achieved through controlling the processes of transcription and RNA degradation that ultimately affect abundance and composition of the mRNA pool. Emerging evidence suggests that the pathways of RNA surveillance and degradation are of paramount importance for fast adaptation of gene expression to stress. One of the most studied mechanisms controlling RNA turnover is nonsense-mediated decay (NMD). It eliminates erroneous transcripts containing premature termination codons (PTC), and also regulates expression of functional transcripts in condition-dependent manner. Recently, my host lab has demonstrated existence of widespread coupling between mRNA decay and translation. This opens a new window for translation dependent regulation of RNA turnover. Specifically, recent studies show that ribosomal frameshifts (RF) occurring during translation induce PTCs and fire NMD response. Preliminary evidence from the host lab suggests that RF is regulated upon stress and could serve as a new mechanism to sense environmental signals and adapt mRNA concentrations. It is yet to be tested if such a regulation is of widespread nature in the cell.
The main goal of this project is to investigate stress-dependent regulation of ribosomal frameshifts and their role in RNA turnover. The 5PSeq approach developed in the host lab will allow for performing high-scale analysis in yeast and human cells, and overcoming existing technological challenges previously limiting research in the field. This project will also explore the cross-talk between RNA turnover and telomere maintenance in cellular response to stress and aging. This will expand the accumulated evidence suggesting interconnection of RNA turnover with other processes involved in cellular adaptability. Finally, I will develop a software package for analysis of RNA degradation datasets that can be used by the research community.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles informatique et science de l'information logiciel
- sciences naturelles sciences biologiques biologie cellulaire
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ARN
- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale physiologie homéostasie
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
PROGRAMME PRINCIPAL
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H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
MSCA-IF-EF-ST - Standard EF
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) H2020-MSCA-IF-2018
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
171 77 STOCKHOLM
Suède
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.