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CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
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Biomarker discovery by AI-guided, image based single-cell isolation proteomics

Description du projet

Un nouveau flux de travail pour la découverte de biomarqueurs de diagnostic précoce du cancer

La détection précoce du cancer est le moyen le plus efficace d’améliorer la survie des patients. Le diagnostic et le pronostic en temps utile dépendent essentiellement de la disponibilité de biomarqueurs spécifiques à la maladie. Le projet Visual Proteomics, financé par l’UE, met au point un nouveau procédé d’acquisition automatisée d’images microscopiques et d’analyse d’images par IA pour identifier des populations de cellules spécifiques dans les échantillons des patients. Ces cellules pourraient être isolées individuellement par microdissection au laser, qui serait suivie d’un profilage protéomique à haute sensibilité pour identifier les protéines spécifiques aux cellules individuelles dans une tumeur donnée et représentant les biomarqueurs candidats les plus prometteurs. Les chercheurs optimiseront le flux de travail pour l’archivage des tissus de la biobanque et cartographieront l’hétérogénéité des tumeurs à une résolution sans précédent.

Objectif

Early detection of severe malignancies such as cancer is the most effective way to increase patient survival, but early diagnosis and prediction of treatment outcome critically depend on disease-specific biomarkers. However, molecular and cellular disease heterogeneity provide a ubiquitous and unresolved challenge to this important task, and therefore impede any attempt to develop personalized therapies. Past and current approaches provide “averaged” descriptions of the tumor composition and have shown very limited success to identify biomarkers. This is likely due to the failure of these methods to identify the critical disease promoting cell populations within the tumor. Therefore, I will develop a new workflow that exploits automated microscopic image acquisition and artificial-intelligence-guided image analysis to identify specific cell populations in patient samples. These cells are then individually isolated by laser microdissection, followed by high-sensitivity proteome profiling, to identify proteins that define the identity of individual cells in a given tumor and thus represent the most promising biomarker candidates. To apply my approach to wide array of diseases, I will optimize it for archival biobank tissues (FFPE), the most common form of solid tissues in pathology. Applied to FFPE samples, my approach will allow me to perform both prospective and retrospective studies, correlate disease state and tissue morphology to protein expression and clinical outcome, and map tumor heterogeneity with unprecedented resolution. To achieve this, I will receive world-class training in cutting-edge microscopy and machine learning techniques in my host laboratory, which I complement with my expertise in high-sensitivity proteomics. My new pipeline will offer a highly fertile ground for new biomarker discoveries, inspire and stimulate collaborative research within and outside the host institute and allow me to establish a highly competitive niche for my future career.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

MSCA-IF-EF-ST - Standard EF

Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme de financement

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) H2020-MSCA-IF-2018

Voir tous les projets financés au titre de cet appel

Coordinateur

KOBENHAVNS UNIVERSITET
Contribution nette de l'UE

La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.

€ 207 312,00
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

€ 207 312,00
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