Biomarker discovery by AI-guided, image based single-cell isolation proteomics

Informations projet

Visual Proteomics

N° de convention de subvention: 846795

DOI 10.3030/846795

Projet clôturé

Date de signature de la CE 26 Mars 2019

Date de début 1 Avril 2019

Date de fin 31 Mars 2021

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions

Coût total € 207 312,00

Contribution de l’UE € 207 312,00

Coordonné par

KOBENHAVNS UNIVERSITET
Danemark

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Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .

Publications

Autres (4)

Ultra-high sensitivity mass spectrometry quantifies single-cell proteome changes upon perturbation

Auteurs: Andreas-David Brunner, Marvin Thielert, Catherine G. Vasilopoulou, Constantin Ammar, Fabian Coscia, Andreas Mund, Ole B. Hoerning, Nicolai Bache, Amalia Apalategui, Markus Lubeck, Sabrina Richter, David S. Fischer, Oliver Raether, Melvin A. Park, Florian Meier, Fabian J. Theis, Matthias Mann
Publié dans: bioRxiv, 2020
Éditeur: bioRxiv
DOI: 10.1101/2020.12.22.423933

Large scale discovery of coronavirus-host factor protein interaction motifs reveals SARS-CoV-2 specific mechanisms and vulnerabilities

Auteurs: Thomas Kruse, Caroline Benz, Dimitriya H. Garvanska, Richard Lindqvist, Filip Mihalic, Fabian Coscia, Ravi Teja Inturi, Ahmed Sayadi, VLeandro Simonetti, Emma Nilsson, Muhammad Ali, Johanna Kliche, Ainhoa Moliner Morro, Andreas Mund, Eva Andersson, Gerald McInerney, Matthias Mann, Per Jemth, Norman E Davey, Anna K Överby, Jakob Nilsson, Ylva Ivarsson
Publié dans: bioRxiv, 2021
Éditeur: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2021.04.19.440086

Clinical Knowledge Graph Integrates Proteomics Data into Clinical Decision-Making

Auteurs: Philipp E. Geyer; Alberto Santos; Lars Juhl Jensen; Ana R. Colaço; Filip Mundt; Annelaura Bach Nielsen; Nicolai J. Wewer Albrechtsen; Fabian Coscia; Lili Niu; Matthias Mann
Publié dans: bioRxiv, Numéro 1, 2020
Éditeur: bioRxiv
DOI: 10.1101/2020.05.09.084897

AI-driven Deep Visual Proteomics defines cell identity and heterogeneity

Auteurs: Andreas Mund, Fabian Coscia, Réka Hollandi, Ferenc Kovács, András Kriston, Andreas-David Brunner, Michael Bzorek, Soraya Naimy, Lise Mette Rahbek Gjerdrum, Beatrice Dyring-Andersen, Jutta Bulkescher, Claudia Lukas, Christian Gnann, Emma Lundberg, Peter Horvath, Matthias Mann
Publié dans: bioRxiv, 2021
Éditeur: bioRxiv
DOI: 10.1101/2021.01.25.427969

Articles approuvés par les pairs (3)

Spatially and cell-type resolved quantitative proteomic atlas of healthy human skin

Auteurs: Beatrice Dyring-Andersen, Marianne Bengtson Løvendorf, Fabian Coscia, Alberto Santos, Line Bruun Pilgaard Møller, Ana R. Colaço, Lili Niu, Michael Bzorek, Sophia Doll, Jørgen Lock Andersen, Rachael A. Clark, Lone Skov, Marcel B. M. Teunissen, Matthias Mann
Publié dans: Nature Communications, Numéro 11/1, 2020, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-020-19383-8

A streamlined mass spectrometry–based proteomics workflow for large‐scale FFPE tissue analysis

Auteurs: Fabian Coscia, Sophia Doll, Jacob Mathias Bech, Lisa Schweizer, Andreas Mund, Ernst Lengyel, Jan Lindebjerg, Gunvor Iben Madsen, José MA Moreira, Matthias Mann
Publié dans: The Journal of Pathology, Numéro 251/1, 2020, Page(s) 100-112, ISSN 0022-3417
Éditeur: John Wiley & Sons Inc.
DOI: 10.1002/path.5420

Homology-directed repair protects the replicating genome from metabolic assaults

Auteurs: Somyajit, Kumar; Spies, Julian; Coscia, Fabian; Kirik, Ufuk; Rask, Maj-Britt; Lee, Ji-Hoon; Neelsen, Kai John; Mund, Andreas; Jensen, Lars Juhl; Paull, Tanya T; Mann, Matthias; Lukas, Jiri.
Publié dans: Developmental Cell, 2021, ISSN 1534-5807
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.devcel.2021.01.011