Descrizione del progetto
Nuovo flusso di lavoro per la scoperta di biomarcatori per la diagnosi precoce del cancro
La diagnosi precoce del cancro è il modo più efficace per migliorare la sopravvivenza del paziente. Una diagnosi e una prognosi tempestive dipendono in modo critico dalla disponibilità di biomarcatori specifici per la malattia. Il progetto Visual Proteomics, finanziato dall’UE, sta sviluppando un nuovo flusso di lavoro di acquisizione automatizzata di immagini microscopiche e analisi di immagini guidata dall’intelligenza artificiale per identificare popolazioni cellulari specifiche in campioni di pazienti. Queste cellule potrebbero essere isolate individualmente mediante microdissezione laser seguita da profilazione proteomica ad alta sensibilità, per identificare le proteine che sono specifiche per le singole cellule in un dato tumore e rappresentano i candidati biomarcatori più promettenti. I ricercatori ottimizzeranno il flusso di lavoro per i tessuti di biobanche archivistiche e mapperanno l’eterogeneità tumorale con una risoluzione senza precedenti.
Obiettivo
Early detection of severe malignancies such as cancer is the most effective way to increase patient survival, but early diagnosis and prediction of treatment outcome critically depend on disease-specific biomarkers. However, molecular and cellular disease heterogeneity provide a ubiquitous and unresolved challenge to this important task, and therefore impede any attempt to develop personalized therapies. Past and current approaches provide “averaged” descriptions of the tumor composition and have shown very limited success to identify biomarkers. This is likely due to the failure of these methods to identify the critical disease promoting cell populations within the tumor. Therefore, I will develop a new workflow that exploits automated microscopic image acquisition and artificial-intelligence-guided image analysis to identify specific cell populations in patient samples. These cells are then individually isolated by laser microdissection, followed by high-sensitivity proteome profiling, to identify proteins that define the identity of individual cells in a given tumor and thus represent the most promising biomarker candidates. To apply my approach to wide array of diseases, I will optimize it for archival biobank tissues (FFPE), the most common form of solid tissues in pathology. Applied to FFPE samples, my approach will allow me to perform both prospective and retrospective studies, correlate disease state and tissue morphology to protein expression and clinical outcome, and map tumor heterogeneity with unprecedented resolution. To achieve this, I will receive world-class training in cutting-edge microscopy and machine learning techniques in my host laboratory, which I complement with my expertise in high-sensitivity proteomics. My new pipeline will offer a highly fertile ground for new biomarker discoveries, inspire and stimulate collaborative research within and outside the host institute and allow me to establish a highly competitive niche for my future career.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine proteomica
- scienze naturali scienze fisiche ottica microscopia
- scienze mediche e della salute medicina clinica oncologia
- scienze mediche e della salute medicina di base patologia
- scienze naturali informatica e scienze dell'informazione intelligenza artificiale apprendimento automatico
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
PROGRAMMA PRINCIPALE
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H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
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Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
MSCA-IF-EF-ST - Standard EF
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) H2020-MSCA-IF-2018
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Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
1165 KOBENHAVN
Danimarca
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.