Description du projet
Des souris grises sauvages peuvent apporter une nouvelle perspective sur le microbiome intestinal
L’une des relations symbiotiques les plus importantes ayant attiré l’attention de la recherche au cours de ces dernières décennies est la relation entre les mammifères et les microbes de leur appareil digestif, collectivement appelés «microbiome». Même au sein d’une espèce mammifère donnée, le microbiome intestinal fait l’objet d’évolutions rapides au cours du développement et reste très variable tout au long de la vie, dépendant de nombreux facteurs. Même si une quantité croissante de preuves suggère que le microbiote aurait un rôle important dans l’immunité et l’alimentation, très peu d’études ont été menées chez des populations sauvages. Le projet MUSMICRO, financé par l’UE, compare des études à long terme chez des souris grises sauvages à des études contrôlées en laboratoire pour déterminer si la variation naturelle du microbiote est réellement corrélée à la santé.
Objectif
The mammalian gut teems with a particularly dense and diverse microbial community, the composition of which varies widely among hosts. A large body of laboratory work suggests these communities provide important functions for the host – including nutrition, pathogen protection and immune development – but we know very little about what shapes the mammalian gut microbiota, and how it affects the host, in natural populations.
A major barrier to progress is a lack of powerful investigative tools for most wild animal species. I will overcome this by studying a natural population of the species that has the best laboratory tools, and knowledge, for the mammalian microbiome: the house mouse. Specifically, I will set up a new wild house mouse system and use it to address three broad questions: 1) what drives natural variation in the gut microbiota? 2) does microbiota variation predict fitness traits in the wild? and, critically, 3) does microbiota variation causally affect fitness-relevant traits? To do this, I will pair detailed, longitudinal studies of wild mice with controlled experiments in the lab, making use of state-of-the-art tools for this species, including: (i) faecal transplant experiments with germ-free animals, to test the phenotypic impact of different wild mouse microbiotas (ii) high resolution genotyping methods and (iii) new radio-frequency identification (RFID) technology we have recently developed for monitoring wild rodent survival and behaviour.
By doing so, this project will directly tackle the key unanswered question: does the composition of the mammalian gut microbiota actually matter in nature?
Champ scientifique
Mots‑clés
Programme(s)
Thème(s)
Régime de financement
ERC-STG - Starting GrantInstitution d’accueil
OX1 2JD Oxford
Royaume-Uni