Opis projektu
Dzikie myszy domowe mogą umożliwić nowe spojrzenie na mikrobiom jelitowy
Jedną z najważniejszych relacji symbiotycznych, które były w ostatnich dziesięcioleciach przedmiotem licznych badań, jest związek pomiędzy ssakami a mikroorganizmami z ich przewodu pokarmowego, nazywanymi zbiorczo mikrobiomem. Nawet w obrębie danego gatunku ssaków mikrobiom jelitowy ulega szybkim zmianom w procesie rozwoju i pozostaje bardzo zmienny przez całe życie, zależnie od wielu czynników. Mimo że coraz więcej dowodów wskazuje na istotną rolę mikrobiomu w odporności i odżywianiu, dotychczas przeprowadzono bardzo niewiele badań na dzikich populacjach. Uczestnicy finansowanego przez UE projektu MUSMICRO porównują długoterminowe badania dzikich myszy domowych z kontrolowanymi badaniami laboratoryjnymi w celu ustalenia, czy naturalne zróżnicowanie mikrobiomu jest faktycznie skorelowane ze zdrowiem.
Cel
The mammalian gut teems with a particularly dense and diverse microbial community, the composition of which varies widely among hosts. A large body of laboratory work suggests these communities provide important functions for the host – including nutrition, pathogen protection and immune development – but we know very little about what shapes the mammalian gut microbiota, and how it affects the host, in natural populations.
A major barrier to progress is a lack of powerful investigative tools for most wild animal species. I will overcome this by studying a natural population of the species that has the best laboratory tools, and knowledge, for the mammalian microbiome: the house mouse. Specifically, I will set up a new wild house mouse system and use it to address three broad questions: 1) what drives natural variation in the gut microbiota? 2) does microbiota variation predict fitness traits in the wild? and, critically, 3) does microbiota variation causally affect fitness-relevant traits? To do this, I will pair detailed, longitudinal studies of wild mice with controlled experiments in the lab, making use of state-of-the-art tools for this species, including: (i) faecal transplant experiments with germ-free animals, to test the phenotypic impact of different wild mouse microbiotas (ii) high resolution genotyping methods and (iii) new radio-frequency identification (RFID) technology we have recently developed for monitoring wild rodent survival and behaviour.
By doing so, this project will directly tackle the key unanswered question: does the composition of the mammalian gut microbiota actually matter in nature?
Dziedzina nauki
Słowa kluczowe
Program(-y)
Temat(-y)
System finansowania
ERC-STG - Starting GrantInstytucja przyjmująca
OX1 2JD Oxford
Zjednoczone Królestwo