PHAGOSCOPY: Dissecting cell-autonomous immunity with ex vivo electron cryo-microscopy

Informations projet

PHAGOSCOPY

N° de convention de subvention: 852880

DOI

10.3030/852880

Projet clôturé

Date de signature de la CE 5 Novembre 2019

Date de début 1 Février 2020

Date de fin 31 Janvier 2026

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 1 438 510,00

Contribution de l’UE

€ 1 438 510,00

Coordonné par

TECHNISCHE UNIVERSITEIT DELFT
Netherlands

CORDIS fournit des liens vers les livrables publics et les publications des projets HORIZON.

Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .

Livrables

Open Research Data Pilot (1)

Data Management Plan

A data management plan on how data generated by the project are stored and made available

Publications

Other (2)

Interactive segmentation of membrane and membrane mimic densities in cryo-EM maps

Auteurs: Alok Bharadwaj, Lotte Veerbeek, Arjen J. Jakobi
Publié dans: BioRxiv, 2026
Éditeur: openRxiv
DOI: 10.64898/2026.02.25.707988

Confidence-guided cryo-EM map optimisation with LocScale-2.0

Auteurs: Alok Bharadwaj, Reinier de Bruin, Arjen J. Jakobi
Publié dans: BioRxiv, 2026
Éditeur: openRxiv
DOI: 10.1101/2025.09.11.674726

Peer reviewed articles (8)

Nanofluidic chips for cryo-EM structure determination from picoliter sample volumes

Auteurs: Stefan T. Huber; Edin Sarajlic; Roeland Huijink; Felix Weis; Wiel H. Evers; Arjen J. Jakobi
Publié dans: eLife, 2022, ISSN 2050-084X
Éditeur: eLife Sciences Publications

Robust Local Thickness Estimation of Sub‐Micrometer Specimen by 4D‐STEM

Auteurs: Radim Skoupý, Daan B. Boltje, Miroslav Slouf, Kateřina Mrázová, Tomáš Láznička, Clémence M. Taisne, Vladislav Krzyžánek, Jacob P. Hoogenboom, Arjen J. Jakobi
Publié dans: Small Methods, Numéro 7, 2024, ISSN 2366-9608
Éditeur: Wiley-VCH GmbH
DOI: 10.1002/smtd.202300258

Thickness- and quality-controlled fabrication of fluorescence-targeted frozen-hydrated lamellae

Auteurs: Daan B. Boltje, Radim Skoupý, Clémence Taisne, Wiel H. Evers, Arjen J. Jakobi, Jacob P. Hoogenboom
Publié dans: Cell Reports Methods, Numéro 5, 2025, Page(s) 101004, ISSN 2667-2375
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.crmeth.2025.101004

Structural basis of antimicrobial membrane coat assembly by human GBP1

Auteurs: Tanja Kuhm, Clémence Taisne, Cecilia de Agrela Pinto, Luca Gross, Evdokia A. Giannopoulou, Stefan T. Huber, Els Pardon, Jan Steyaert, Sander J. Tans, Arjen J. Jakobi
Publié dans: Nature Structural & Molecular Biology, Numéro 32, 2025, Page(s) 172-184, ISSN 1545-9993
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41594-024-01400-9

Workflow for Fluorescence-Targeted Lamella Milling From Vitrified Cells With a Coincident Fluorescence, Electron, and Ion Beam Microscope

Auteurs: Elise Perton, Daan Boltje, Arjen Jakobi, Jacob Hoogenboom
Publié dans: BIO-PROTOCOL, Numéro 15, 2025, ISSN 2331-8325
Éditeur: Bio-Protocol, LLC
DOI: 10.21769/bioprotoc.5390

A cryogenic, coincident fluorescence, electron, and ion beam microscope

Auteurs: Daan B Boltje, Jacob P Hoogenboom, Arjen J Jakobi, Grant J Jensen, Caspar TH Jonker, Max J Kaag, Abraham J Koster, Mart GF Last, Cecilia de Agrela Pinto, Jürgen M Plitzko, Stefan Raunser, Sebastian Tacke, Zhexin Wang, Ernest B van der Wee, Roger Wepf, Sander den Hoedt
Publié dans: eLife, 2022, ISSN 2050-084X
Éditeur: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.82891

Femtolitre Volume cryoEM Sample Preparation Using a Force‐Sensitive Microfluidic Cantilever

Auteurs: Vijayendra Shastri, Joachim Pronk, Eleonoor Verlinden, Daniel Torres González, Edin Sarajlic, Paul Laeven, Wiel Evers, Patrick Frederix, Urs Staufer, Arjen J. Jakobi, Murali Krishna Ghatkesar, Andreas Engel
Publié dans: Advanced Materials Technologies, Numéro 10, 2026, ISSN 2365-709X
Éditeur: Wiley
DOI: 10.1002/admt.202501333

Electron scattering properties of biological macromolecules and their use for cryo-EM map sharpening

Auteurs: Arjen Jakobi; Alok Bharadwaj
Publié dans: Faraday Discussions, 2022, Page(s) 168-183, ISSN 1359-6640
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d2fd00078d