Systems biology of the individual stochastic timer of aging

Informations projet

AgingTimer

N° de convention de subvention: 856487

DOI

10.3030/856487

Date de signature de la CE 16 Janvier 2020

Date de début 1 Février 2020

Date de fin 31 Janvier 2027

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 8 687 500,00

Contribution de l’UE

€ 8 687 500,00

Coordonné par

WEIZMANN INSTITUTE OF SCIENCE
Israel

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Publications

Peer reviewed articles (26)

A new model for the HPA axis explains dysregulation of stress hormones on the timescale of weeks

Auteurs: Omer Karin, Moriya Raz, Avichai Tendler, Alon Bar, Yael Korem Kohanim, Tomer Milo, Uri Alon
Publié dans: Molecular Systems Biology, Numéro 16/7, 2020, ISSN 1744-4292
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.15252/msb.20209510

p21 regulates expression of ECM components and promotes pulmonary fibrosis via CDK4 and Rb

Auteurs: Nurit Papismadov, Naama Levi, Lior Roitman, Amit Agrawal, Yossi Ovadya, Ulysse Cherqui, Reut Yosef, Hagay Akiva, Hilah Gal, Valery Krizhanovsky
Publié dans: The EMBO Journal, 2024, ISSN 1460-2075
Éditeur: EMBO Press
DOI: 10.1038/s44318-024-00246-7

p16-dependent increase of PD-L1 stability regulates immunosurveillance of senescent cells

Auteurs: Julia Majewska, Amit Agrawal, Avi Mayo, Lior Roitman, Rishita Chatterjee, Jarmila Sekeresova Kralova, Tomer Landsberger, Yonatan Katzenelenbogen, Tomer Meir-Salame, Efrat Hagai, Ilanit Sopher, Juan-Felipe Perez-Correa, Wolfgang Wagner, Avi Maimon, Ido Amit, Uri Alon, Valery Krizhanovsky
Publié dans: Nature Cell Biology, Numéro 26, 2024, Page(s) 1336-1345, ISSN 1465-7392
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41556-024-01465-0

Sexually dimorphic oxytocin circuits drive intragroup social conflict and aggression in wild house mice

Auteurs: Yizhak Sofer, Noga Zilkha, Elena Gimpel, Shlomo Wagner, Silvia Gabriela Chuartzman, Tali Kimchi
Publié dans: Nature Neuroscience, Numéro 27, 2024, Page(s) 1565-1573, ISSN 1097-6256
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41593-024-01685-5

An opponent process for alcohol addiction based on changes in endocrine gland mass

Auteurs: Omer Karin, Moriya Raz, Uri Alon
Publié dans: iScience, Numéro 24/3, 2021, Page(s) 102127, ISSN 2589-0042
Éditeur: Elsevier
DOI: 10.1016/j.isci.2021.102127

Endocrine gland size is proportional to its target tissue size

Auteurs: Moriya Raz, Tomer Milo, David S. Glass, Avi Mayo, Uri Alon
Publié dans: iScience, Numéro 27, 2024, Page(s) 110625, ISSN 2589-0042
Éditeur: Elseiver
DOI: 10.1016/j.isci.2024.110625

Timescales of Human Hair Cortisol Dynamics

Auteurs: Lior Maimon, Tomer Milo, Rina S. Moyal, Avi Mayo, Tamar Danon, Anat Bren, Uri Alon
Publié dans: iScience, Numéro 23/9, 2020, Page(s) 101501, ISSN 2589-0042
Éditeur: Elsevier
DOI: 10.1016/j.isci.2020.101501

Rules for body fat interventions based on an operating point mechanism

Auteurs: Alon Bar, Omer Karin , Avi Mayo , Danny Ben-Zvi , Uri Alon
Publié dans: iScience, 2023, ISSN 2589-0042
Éditeur: CellPress
DOI: 10.1016/j.isci.2023.106047

Identification of senescent, TREM2-expressing microglia in aging and Alzheimer’s disease model mouse brain

Auteurs: Noa Rachmian, Sedi Medina, Ulysse Cherqui, Hagay Akiva, Daniel Deitch, Dunya Edilbi, Tommaso Croese, Tomer Meir Salame, Javier Maria Peralta Ramos, Liora Cahalon, Valery Krizhanovsky, Michal Schwartz
Publié dans: Nature Neuroscience, Numéro 27, 2024, Page(s) 1116-1124, ISSN 1097-6256
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41593-024-01620-8

Maternal high-fat or low-protein diets promote autism-related behavior and altered social behavior within groups in offspring male mice

Auteurs: Noga Zilkha, Silvia Gabriela Chuartzman, Ruth Fishman, Shifra Ben-Dor, Tali Kimchi
Publié dans: Scientific Reports, Numéro 14, 2024, ISSN 2045-2322
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-024-70062-w

Major depressive disorder and bistability in an HPA-CNS toggle switch

Auteurs: Ben Ron Mizrachi, Avichai Tendler, Omer Karin, Tomer Milo, Dafna Haran, Avi Mayo, Uri Alon
Publié dans: PLOS Computational Biology, Numéro 19, 2023, Page(s) e1011645, ISSN 1553-7358
Éditeur: PLOS
DOI: 10.1371/journal.pcbi.1011645

Senescent cells and the incidence of age‐related diseases

Auteurs: Itay Katzir, Miri Adler, Omer Karin, Netta Mendelsohn‐Cohen, Avi Mayo, Uri Alon
Publié dans: Aging Cell, Numéro 20/3, 2021, ISSN 1474-9718
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/acel.13314

Senescent cell accumulation mechanisms inferred from parabiosis

Auteurs: Omer Karin, Uri Alon
Publié dans: GeroScience, Numéro 43/1, 2021, Page(s) 329-341, ISSN 2509-2715
Éditeur: Springer
DOI: 10.1007/s11357-020-00286-x

Alone, in the dark: The extraordinary neuroethology of the solitary blind mole rat

Auteurs: Yael Kashash, Grace Smarsh, Noga Zilkha, Yossi Yovel, Tali Kimchi
Publié dans: eLife, 2022, ISSN 2050-084X
Éditeur: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.78295

The social network: Neural control of sex differences in reproductive behaviors, motivation, and response to social isolation

Auteurs: Noga Zilkha, Yizhak Sofer, Yael Kashash, Tali Kimchi
Publié dans: Current Opinion in Neurobiology, Numéro 68, 2021, Page(s) 137-151, ISSN 0959-4388
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.conb.2021.03.005

p21 facilitates chronic lung inflammation via epithelial and endothelial cells

Auteurs: Naama Levi, , Nurit Papismadov, Julia Majewska , Lior Roitman, Noa Wigoda , Raya Eilam, Michael Tsoory , Ron Rotkopf , Yossi Ovadya , Hagay Akiva , Ofer Regev , Valery Krizhanovsky
Publié dans: Aging, 2023, ISSN 1945-4589
Éditeur: Albany
DOI: 10.18632/aging.204622

Temporal fluctuations in chemotaxis gain implement a simulated-tempering strategy for efficient navigation in complex environments

Auteurs: Omer Karin, Uri Alon
Publié dans: iScience, Numéro 24/7, 2021, Page(s) 102796, ISSN 2589-0042
Éditeur: Elsevier
DOI: 10.1016/j.isci.2021.102796

Longitudinal hair cortisol in bipolar disorder and a mechanism based on HPA dynamics

Auteurs: Tomer Milo, Lior Maimon, Ben Cohen, Dafna Haran, Dror Segman, Tamar Danon, Anat Bren, Avi Mayo , Gadi Cohen Rappaport , Melvin McInnis , Uri Alon
Publié dans: iScience, 2024, ISSN 2589-0042
Éditeur: Elsiever
DOI: 10.1016/j.isci.2024.109234

Geroprotective interventions converge on gene expression programs of reduced inflammation and restored fatty acid metabolism

Auteurs: Tomer Landsberger, Ido Amit, Uri Alon
Publié dans: GeroScience, 2023, ISSN 2509-2723
Éditeur: Springer
DOI: 10.1007/s11357-023-00915-1

Damage dynamics and the role of chance in the timing of E. coli cell death

Auteurs: Yifan Yang ,Omer Karin, Avi Mayo , Xiaohu Song ,Peipei Chen , Ana L. Santos, Ariel B. Lindner, Uri Alon
Publié dans: Nature Communications, 2023, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-37930-x

Autoimmune thyroid diseases as a cost of physiological autoimmune surveillance

Auteurs: Tomer Milo, Yael Korem Kohanim, Yoel Toledano, Uri Alon
Publié dans: Trends in Immunology, 2023, ISSN 1471-4906
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.it.2023.03.007

A synthetic differentiation circuit in Escherichia coli for suppressing mutant takeover

Auteurs: David S. Glass, Anat Bren, Elizabeth Vaisbourd, Avi Mayo, Uri alon
Publié dans: Cell, 2024, ISSN 0092-8674
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2024.01.024

Sex-dependent control of pheromones on social organization within groups of wild house mice

Auteurs: Noga Zilkha , Silvia Gabriela Chuartzman , Yizhak Sofer , Yefim Pen , Meghan Cum, Avi Mayo , Uri Alon , Tali Kimchi
Publié dans: Current Biology, 2023, ISSN 0960-9822
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cub.2023.02.039

Tradeoffs in bacterial physiology determine the efficiency of antibiotic killing

Auteurs: Anat Bren, David S. Glass, Yael Koem Kohanim, Avi Mayo, Uri Alon
Publié dans: PNAS, 2023, ISSN 0027-8424
Éditeur: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.2312651120

Excitable dynamics of flares and relapses in autoimmune diseases

Auteurs: Yael Lebel, Tomer Milo, Alon Bar, Avi Mayo, Uri Alon
Publié dans: iScience, 2023, ISSN 2589-0042
Éditeur: Elseiver
DOI: 10.1016/j.isci.2023.108084

Senolytic elimination of Cox2-expressing senescent cells inhibits the growth of premalignant pancreatic lesions

Auteurs: Dror Kolodkin-Gal, Lior Roitman, Yossi Ovadya, Narmen Azazmeh, Benjamin Assouline, Yehuda Schlesinger, Rachel Kalifa, Shaul Horwitz, Yonatan Khalatnik, Anna Hochner-Ger, Ashraf Imam, Jonathan Abraham Demma, Eitan Winter, Hadar Benyamini, Sharona Elgavish, Areej AS Khatib, Karen Meir, Karine Atlan, Eli Pikarsky, Oren Parnas, Yuval Dor, Gideon Zamir, Ittai Ben-Porath, Valery Krizhanovsky
Publié dans: Gut, 2021, Page(s) gutjnl-2020-321112, ISSN 0017-5749
Éditeur: BMJ Publishing Group
DOI: 10.1136/gutjnl-2020-321112

Non-peer reviewed articles (3)

Cellular senescence in ageing: from mechanisms to therapeutic opportunities

Auteurs: Raffaella Di Micco, Valery Krizhanovsky, Darren Baker & Fabrizio d’Adda di Fagagna
Publié dans: Nature Reviews Molecular Cell Biology, 2021, ISSN 1471-0072
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41580-020-00314-w

The intricate nature of senescence in development and cell plasticity

Auteurs: Hilah Gal , Julia Majewska , Valery Krizhanovsky
Publié dans: Seminars in cancer Biology, 2022, ISSN 1044-579X
Éditeur: Academic Press
DOI: 10.1016/j.semcancer.2021.01.004

Senescent cells in the brain and where to find them

Auteurs: Noa Rachmian, Valery Krizhanovsky
Publié dans: The FEBS Journal, 2023, ISSN 1742-4658
Éditeur: Wiley
DOI: 10.1111/febs.16649