Description du projet
Suivre l’ADN en mouvement fera la lumière sur son rôle pour éviter les antibiotiques
La structure et la fonction de l’ADN, et même le fait que les ADN ne contiennent pas tous les codes pour constituer des protéines, font vraisemblablement désormais partie des connaissances générales. Les scientifiques savent également depuis plus de 50 ans que certaines séquences d’ADN peuvent se déplacer dans le génome en modifiant leur nombre ou leur position, ce qui affecte souvent l’activité des gènes voisins. Certaines estimations indiquent que ces éléments d’ADN mobiles composeraient près de la moitié de notre génome. De plus en plus de preuves soutiennent que les éléments génétiques mobiles jouent un rôle principal dans la résistance aux antibiotiques par le biais de leur capacité à se déplacer eux-mêmes et à déplacer des gènes de résistance associés vers de nouvelles positions dans la même molécule d’ADN ou des molécules différentes de la même cellule. Toutefois, ces mécanismes sont largement méconnus. Le projet mARs, financé par l’UE, a adopté des approches expérimentales et bio-informatiques pour faire la lumière sur les mécanismes et la diversité de la résistance aux antimicrobiens liée à l’ADN mobile.
Objectif
Antibiotic resistance (AR) is spreading rapidly, leading to the development of highly virulent pathogens and multidrug-resistant superbugs, a major health concern of our era. Mobile DNA elements, transposons and integrons, effectively drive the spread of AR genes in microbial interaction hotspots, such as bacterial communities in humans and natural environments. Yet, our knowledge of their mechanisms remains very sparse. It is unclear how DNA movement occurs on the molecular level and how it is controlled in cells and communities; biochemical and structural data are rare and our view on their diversity and evolution is limited. Here I propose an integrated approach combining bioinformatics, genetics, microbiology, biochemistry, and structural biology to elucidate the mechanisms and diversity of mobile DNA driven resistance spreading. I want to (a) investigate the molecular mechanisms and regulation of AR gene movement in vitro, in model bacteria and in gut bacterial communities; (b) dissect the structure of the underlying molecular machineries to reveal how protein-DNA interplay promotes gene transfer; and (c) characterize the diversity, evolution and functional success of distinct molecular pathways. Mechanistic work will focus on selected mobile elements that confer resistance to last resort drugs and promiscuous gene carriers with high prevalence in health care. Bioinformatic quests will draw on recent (meta)genomic data to chart the clinical significance of molecular insights in situ. By bridging disciplines, I want to provide functionally annotated molecular movies of gene movement and explain how specific molecular strategies evolved to enable broad dissemination of resistance determinants. The insights gained in this research will provide in-depth knowledge on major AR transfer pathways and will have key implications for the development of novel intervention strategies and preventive measures aimed at reducing dissemination of drug resistance in bacteria.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences médicales et de la santé biotechnologie médicale génie génétique thérapie génique
- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie bactériologie
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ADN
- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale pharmacologie et pharmacie résistance aux médicaments résistance aux antibiotiques
- sciences naturelles sciences biologiques biologie moléculaire biologie structurale
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
ERC-COG - Consolidator Grant
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2019-COG
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
1211 Geneve
Suisse
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.