Using Deep Learning to understand RNA Binding Protein binding characteristics

Información del proyecto

DEEPLEARNRBP

Identificador del acuerdo de subvención: 867414

DOI

10.3030/867414

Proyecto cerrado

Fecha de la firma de la CE 26 Abril 2019

Fecha de inicio 1 Julio 2019

Fecha de finalización 9 Mayo 2022

Financiado con arreglo a

• SPREADING EXCELLENCE AND WIDENING PARTICIPATION

Coste total

€ 156 980,64

Aportación de la UE

€ 156 980,64

Coordinado por

Masarykova univerzita
Czechia

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Publicaciones

Peer reviewed articles (2)

PENGUINN: Precise Exploration of Nuclear G-Quadruplexes Using Interpretable Neural Networks

Autores: Klimentova, E., Polacek, J., Simecek, P., & Alexiou, P.
Publicado en: FRONTIERS IN GENETICS, 2020, ISSN 1664-8021
Editor: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fgene.2020.568546

ENNGene: an Easy Neural Network model building tool for Genomics

Autores: CHALUPOVÁ, Eliška, Ondřej VACULÍK, Jakub POLÁČEK, Filip JOZEFOV, Tomáš MAJTNER a Panagiotis ALEXIOU
Publicado en: BMC Genomics, 2022, ISSN 1471-2164
Editor: BioMed Central
DOI: 10.1186/s12864-022-08414-x

Non-peer reviewed articles (1)

Genomic Benchmarks: A Collection of Datasets for Genomic Sequence Classification bioRxiv

Autores: Gresova K, Martinek V, Cechak D, Simecek P, Alexiou P
Publicado en: BIORXIV, 2022, ISSN 1664-8021
Editor: Frontiers Media
DOI: 10.1101/2022.06.08.495248