Skip to main content

Pan-genome Graph Algorithms and Data Integration

Descripción del proyecto

Graph-based representation of the genome sequence data

Modern sequencing technology produces genome sequence data on a gigantic scale reaching into exabytes. The emerging urgent question is how these volumes of data could be arranged and analysed in a computationally efficient and biomedically meaningful manner. This EU-funded project is going to explore graph-based representation of large genome datasets and determine their advantages over traditional sequence-based presentation of pan-genomic data. Genomes that are evolutionarily close vary only a little and graph-based pan-genomic representation allows to remove redundancies while highlighting important differences. The research is going to demonstrate the advantage of the shift to the new data representation approach using comparative analysis, compression, integration and exploitation of genome data as the fundamental points.

Ámbito científico

  • /ciencias naturales/ciencias biológicas/genética y herencia genética
  • /ciencias naturales/ciencias biológicas/genética y herencia genética/nucleótido
  • /ciencias naturales/ciencias biológicas/genética y herencia genética/genoma
  • /ciencias sociales/derecho

Convocatoria de propuestas

H2020-MSCA-RISE-2019
Consulte otros proyectos de esta convocatoria

Régimen de financiación

MSCA-RISE - Marie Skłodowska-Curie Research and Innovation Staff Exchange (RISE)

Coordinador

UNIVERSITA' DEGLI STUDI DI MILANO-BICOCCA
Dirección
Piazza Dell'ateneo Nuovo 1
20126 Milano
Italia
Tipo de actividad
Higher or Secondary Education Establishments
Aportación de la UE
€ 197 800

Participantes (6)

STICHTING NEDERLANDSE WETENSCHAPPELIJK ONDERZOEK INSTITUTEN
Países Bajos
Aportación de la UE
€ 142 600
Dirección
Winthontlaan 2
3526 KV Utrecht
Tipo de actividad
Research Organisations
UNIVERSITAET BIELEFELD
Alemania
Aportación de la UE
€ 202 400
Dirección
Universitaetsstrasse 25
33615 Bielefeld
Tipo de actividad
Higher or Secondary Education Establishments
UNIVERZITA KOMENSKEHO V BRATISLAVE
Eslovaquia
Aportación de la UE
€ 128 800
Dirección
Safarikovo Nam 6
814 99 Bratislava
Tipo de actividad
Higher or Secondary Education Establishments
GENETON S.R.O.
Eslovaquia
Aportación de la UE
€ 322 000
Dirección
Ilkovicova 8
841 04 Bratislava
Tipo de actividad
Private for-profit entities (excluding Higher or Secondary Education Establishments)
INSTITUT PASTEUR
Francia
Aportación de la UE
€ 147 200
Dirección
Rue Du Docteur Roux 25-28
75724 Paris Cedex 15
Tipo de actividad
Research Organisations
ILLUMINA CAMBRIDGE LTD
United Kingdom
Aportación de la UE
€ 0
Dirección
Illumina Centre 19 Granta Park
CB21 9DF Great Abington
Tipo de actividad
Private for-profit entities (excluding Higher or Secondary Education Establishments)

Socios (4)

CORNELL UNIVERSITY
Estados Unidos
Dirección
Pine Tree Road 373
14850 Ithaca Ny
Tipo de actividad
Higher or Secondary Education Establishments
NATIONAL UNIVERSITY CORPORATION THEUNIVERSITY OF TOKYO
Japón
Dirección
Hongo Bunkyo Ku 7 3 1
113 8656 Tokyo
Tipo de actividad
Higher or Secondary Education Establishments
Simon Fraser University
Canadá
Dirección
University Drive 8888
V5A 1S6 Burnaby
Tipo de actividad
Higher or Secondary Education Establishments
The Pennsylvania State University
Estados Unidos
Dirección
Technology Center Bldg. 110
16802 University Park
Tipo de actividad
Higher or Secondary Education Establishments