Descripción del proyecto
Una plataforma de organoides de tejidos humanos en el marco de la iniciativa del Atlas de células humanas
El proyecto del Atlas de células humanas es una iniciativa científica mundial destinada a mapear y caracterizar todas las células del cuerpo humano por tipo, cantidad, ubicación, relación y estructura molecular. Será un recurso fundamental para los científicos que permitirá comprender cómo funcionan las células sanas y qué ocurre en caso de enfermedad. El proyecto financiado con fondos europeos HCA Organoid creará un atlas de organoides humanos dentro de la iniciativa del Atlas de células humanas con el fin de mejorar la capacidad de obtener conclusiones funcionales, causales y mecanicistas relevantes para las enfermedades humanas. El proyecto determinará los transcriptomas de células individuales, los epigenomas de células individuales y los datos de imagenología de miles de organoides y los tejidos primarios correspondientes. Inicialmente se centrará en el colon y el encéfalo, y se incluirán órganos adicionales como estudios piloto. En general, este recurso permitirá la caracterización de variaciones en la población normal y proporcionará una línea de referencia para los estudios de enfermedades.
Objetivo
"Excellence: The Human Cell Atlas (HCA) is descriptive by definition, as it seeks to map all cells in the human body. Yet its goal of “understanding fundamental human biological processes and diagnosing, monitoring, and treating disease” (HCA Whitepaper) depends on our ability to draw functional/causal/mechanistic conclusions relevant to human diseases. Personalized organoid technology aptly fills this gap, as it makes human tissue amenable to functional studies and faithful disease modeling in vitro.
This project will firmly establish a ""Human Organoid Atlas"" within the HCA. Initially focusing on two organs (colon and brain: 100 distinct organoid lines each). We will establish single-cell transcriptomes, single-cell epigenomes, and time-series imaging for several thousand organoids and matched primary tissue. This resource will primarily quantify normal population variation and provide a baseline for disease studies. Moreover, the project will include data generation and analysis of >20 colorectal cancer organoid lines with matching organoid lines derived from normal (healthy) material as well as the respective matching primary tissue. We will show the practical utility of the resource by proof-of-concept disease modeling for genetic epilepsy (brain) and large-scale characterization of disease-linked genetic variants (colon).
Impact: 1. Deeply characterized organoid collection enables functional and disease-centric studies pursuing HCA insights. 2. Single-cell dataset provides reference of population variation under highly standardized conditions. 3. Linking single-cell profiling and organoids will boost HCA’s impact on human health.
Implementation: The project connects the European founders of organoid research (Hans Clevers, Jürgen Knoblich) with expertise in large-scale epigenome/transcriptome profiling (Christoph Bock, Henk Stunnenberg), advanced imaging (Prisca Liberali, Anne Rios), bioinformatics and systems genetics (Oliver Stegle, Michael Boutros), data management (Laura Clarke/EBI), and strong SME contribution (Hubrecht Organoid Technology, Eurice). The project is fully committed to the HCA's values. It implements extensive data sharing and sustainability measures."
Ámbito científico
Palabras clave
Programa(s)
Convocatoria de propuestas
Consulte otros proyectos de esta convocatoriaConvocatoria de subcontratación
H2020-SC1-2019-Single-Stage-RTD
Régimen de financiación
RIA - Research and Innovation actionCoordinador
1090 Wien
Austria