Projektbeschreibung
Plattform menschlicher Gewebe-Organoide im Human Cell Atlas
Das Projekt Human Cell Atlas (Atlas der menschlichen Zellen) ist eine globale wissenschaftliche Initiative mit dem Ziel, alle Zellen im menschlichen Körper nach Typ, Anzahl, Lage, Beziehungen und Molekularstruktur zu erfassen und zu charakterisieren. Er wird als grundlegende künftige Ressource für die Wissenschaft betrachtet, da er Rückschlüsse darüber zulässt, wie gesunde Zellen funktionieren und was im Falle einer Erkrankung geschieht. Das EU-finanzierte Projekt HCA Organoid wird im Rahmen des Atlas der menschlichen Zellen einen Atlas über die menschlichen Organoide erstellen. Ziel ist es, die Möglichkeit auszubauen, funktionale, kausale und mechanistische Schlüsse zu ziehen, die für menschliche Erkrankungen relevant sind. Das Projekt wird Transkriptome einzelner Zellen, Epigenome einzelner Zellen und Bildgebungsdaten für mehrere Tausend Organoide sowie passendes Primärgewebe erarbeiten. Zunächst wird der Schwerpunkt auf dem Dickdarm und dem Gehirn liegen. Weitere Organe werden als Pilotstudien miteinbezogen. Insgesamt wird diese Ressource die Charakterisierung normaler Populationsvariationen ermöglichen und eine Grundlage für die Untersuchung von Erkrankungen liefern.
Ziel
"Excellence: The Human Cell Atlas (HCA) is descriptive by definition, as it seeks to map all cells in the human body. Yet its goal of “understanding fundamental human biological processes and diagnosing, monitoring, and treating disease” (HCA Whitepaper) depends on our ability to draw functional/causal/mechanistic conclusions relevant to human diseases. Personalized organoid technology aptly fills this gap, as it makes human tissue amenable to functional studies and faithful disease modeling in vitro.
This project will firmly establish a ""Human Organoid Atlas"" within the HCA. Initially focusing on two organs (colon and brain: 100 distinct organoid lines each). We will establish single-cell transcriptomes, single-cell epigenomes, and time-series imaging for several thousand organoids and matched primary tissue. This resource will primarily quantify normal population variation and provide a baseline for disease studies. Moreover, the project will include data generation and analysis of >20 colorectal cancer organoid lines with matching organoid lines derived from normal (healthy) material as well as the respective matching primary tissue. We will show the practical utility of the resource by proof-of-concept disease modeling for genetic epilepsy (brain) and large-scale characterization of disease-linked genetic variants (colon).
Impact: 1. Deeply characterized organoid collection enables functional and disease-centric studies pursuing HCA insights. 2. Single-cell dataset provides reference of population variation under highly standardized conditions. 3. Linking single-cell profiling and organoids will boost HCA’s impact on human health.
Implementation: The project connects the European founders of organoid research (Hans Clevers, Jürgen Knoblich) with expertise in large-scale epigenome/transcriptome profiling (Christoph Bock, Henk Stunnenberg), advanced imaging (Prisca Liberali, Anne Rios), bioinformatics and systems genetics (Oliver Stegle, Michael Boutros), data management (Laura Clarke/EBI), and strong SME contribution (Hubrecht Organoid Technology, Eurice). The project is fully committed to the HCA's values. It implements extensive data sharing and sustainability measures."
Wissenschaftliches Gebiet
Schlüsselbegriffe
Programm/Programme
Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
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H2020-SC1-2019-Single-Stage-RTD
Finanzierungsplan
RIA - Research and Innovation actionKoordinator
1090 Wien
Österreich