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Unlocking the potential of cryo-electron tomography by simplification of the sample preparation workflow

Descripción del proyecto

Mejora de la tomografía crioelectrónica gracias a la preparación automática de muestras

Las técnicas de microscopía de superresolución han revolucionado campos que van desde la ciencia de los materiales hasta la medicina. La microscopía crioelectrónica (cryo-EM, por sus siglas en inglés) ha sido un elemento determinante para la imagenología de alta resolución de moléculas y tejidos biológicos. Las moléculas biológicas son propensas a la destrucción y sensibles la contaminación cuando sus medios acuosos se ven alterados. La Cryo-EM mantiene las ventajas de la microscopía electrónica de transmisión y amplía su utilidad mediante la utilización de muestras enfriadas criogénicamente incorporadas a un medio de agua vítrea. La tomografía crioelectrónica (cryo-ET, por sus siglas en inglés) es capaz de hacer lo mejor todavía mejor con la alineación asistida por ordenador de imágenes en dos dimensiones para producir una reconstrucción en tres dimensiones de la muestra. Sin embargo, el tiempo y la complejidad de la preparación de muestras dan lugar a una elevada proporción de fracasos. Cryo-SECOM Workflow está desarrollando una plataforma de preparación de muestras completamente automatizada para garantizar que los investigadores biomédicos alcancen las maravillosas promesas de la cryo-ET.

Objetivo

"The interest for cryo electron microscopy (cryo-EM) has risen tremendously since the Nobel Prize in Chemistry 2017 was given for Cryo-EM. The next step in Cryo EM, Cryo Electron Tomography (cryo-ET), makes it possible to resolve tertiary and quaternary protein structure interactions in relevant biological samples such as cells and bacteria. However, in the current cryo-ET workflow the sample preparation is the bottleneck. Today, sample preparation is a manual process of 4-8 hours, involves 22 steps and is performed by a PhD level operator. Even so, >80% of the samples end up unusable, due to the extreme complexity of making samples. Sample preparation is therefore also incredibly costly, as imaging time on expensive Cryo-TEMs is wasted on trying to image unusable samples. In order to make cryo-ET fulfil its potential, the sample preparation has to become fast, cheap and reliable.
DELMIC has completely reimagined the cryo-ET workflow, with the ultimate vision of completely automating sample preparation. Central to this workflow is the cryo-SECOM, which integrates a correlated cryo light microscope with a FIB/SEM system. Additionally, a unified carrier simplifies the placing and carrying samples around and the sample handling and loading/unloading procedures are automatized. We will tie all workstations together, basically creating a ‘cryo-ET sample prep robot’. This fully integrated workflow approach reduces the switching between many workstations, gives higher yield, and offers unprecedented precision in targeting the area of interest.
By simplifying the workflow and reducing the preparation time, the Cryo-SECOM Workflow will allow researchers to innovate faster, decreasing the sample preparation time by 87% and improving the yield by 8-fold. The cost per sample will be greatly reduced by 90%. The Cryo-SECOM Workflow will be key in unlocking the full potential cryo-ET, opening new horizons in structural biology research.
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Ámbito científico (EuroSciVoc)

CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural.

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Convocatoria de propuestas

H2020-EIC-SMEInst-2018-2020

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Convocatoria de subcontratación

H2020-SMEInst-2018-2020-2

Régimen de financiación

SME-2 - SME instrument phase 2

Coordinador

DELMIC BV
Aportación neta de la UEn
€ 2 143 750,00
Dirección
KANAALWEG 4
2628EB Delft
Países Bajos

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Pyme

Organización definida por ella misma como pequeña y mediana empresa (pyme) en el momento de la firma del acuerdo de subvención.

Tipo de actividad
Private for-profit entities (excluding Higher or Secondary Education Establishments)
Enlaces
Coste total
€ 3 062 500,00