Opis projektu
Zautomatyzowane przygotowanie próbki ulepszy tomografię krioelektronową
Techniki mikroskopowania gwarantujące wysoką rozdzielczość na zawsze odmieniły wiele dziedzin – od badań materiałowych po medycynę. Mikroskopia krioelektronowa (ang. cryo-electron microscopy, cryo-EM) zrewolucjonizowała obrazowanie tkanek i cząsteczek w wysokiej rozdzielczości. Próbki biologiczne są podatne na zniszczenie i zanieczyszczenie, jeśli ich środowisko wodne zostaje zaburzone. Cryo-EM zachowuje zalety transmisyjnej mikroskopii elektronowej (ang. transmission electron microscopy), ale cechuje się szerszym zastosowaniem ze względu na wykorzystywane w niej próbki schładzane ciekłym azotem i umieszczone w lodzie amorficznym. Tomografia krioelektronowa (ang. cryo-electron tomography, cryo-ET) idzie jeszcze o krok dalej dzięki wspieranemu komputerowo nakładaniu obrazów 2D, w wyniku którego generowana jest rekonstrukcja 3D próbki. Jednak ze względu na czasochłonność i złożoność procesu przygotowania próbki, metoda ta bardzo często kończy się niepowodzeniem. W ramach projektu Cryo-SECOM Workflow powstaje w pełni zautomatyzowana platforma przygotowująca próbki, dzięki której naukowcy w dziedzinie biomedycyny docenią niesamowity potencjał tomografii krioelektronowej.
Cel
"The interest for cryo electron microscopy (cryo-EM) has risen tremendously since the Nobel Prize in Chemistry 2017 was given for Cryo-EM. The next step in Cryo EM, Cryo Electron Tomography (cryo-ET), makes it possible to resolve tertiary and quaternary protein structure interactions in relevant biological samples such as cells and bacteria. However, in the current cryo-ET workflow the sample preparation is the bottleneck. Today, sample preparation is a manual process of 4-8 hours, involves 22 steps and is performed by a PhD level operator. Even so, >80% of the samples end up unusable, due to the extreme complexity of making samples. Sample preparation is therefore also incredibly costly, as imaging time on expensive Cryo-TEMs is wasted on trying to image unusable samples. In order to make cryo-ET fulfil its potential, the sample preparation has to become fast, cheap and reliable.
DELMIC has completely reimagined the cryo-ET workflow, with the ultimate vision of completely automating sample preparation. Central to this workflow is the cryo-SECOM, which integrates a correlated cryo light microscope with a FIB/SEM system. Additionally, a unified carrier simplifies the placing and carrying samples around and the sample handling and loading/unloading procedures are automatized. We will tie all workstations together, basically creating a ‘cryo-ET sample prep robot’. This fully integrated workflow approach reduces the switching between many workstations, gives higher yield, and offers unprecedented precision in targeting the area of interest.
By simplifying the workflow and reducing the preparation time, the Cryo-SECOM Workflow will allow researchers to innovate faster, decreasing the sample preparation time by 87% and improving the yield by 8-fold. The cost per sample will be greatly reduced by 90%. The Cryo-SECOM Workflow will be key in unlocking the full potential cryo-ET, opening new horizons in structural biology research.
""
"
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
- nauki przyrodniczenauki biologicznemikrobiologiabakteriologia
- nauki przyrodniczenauki biologicznebiochemiabiocząsteczkibiałka
- nauki przyrodniczenauki fizyczneoptykamikroskopiaelectron microscopy
- nauki przyrodniczenauki biologicznebiologia molekularnabiologia strukturalna
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Słowa kluczowe
Program(-y)
Temat(-y)
Zaproszenie do składania wniosków
Zobacz inne projekty w ramach tego zaproszeniaSzczegółowe działanie
H2020-SMEInst-2018-2020-2
System finansowania
SME-2 - SME instrument phase 2Koordynator
2628EB Delft
Niderlandy
Organizacja określiła się jako MŚP (firma z sektora małych i średnich przedsiębiorstw) w czasie podpisania umowy o grant.