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CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
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Determining in vivo protein structures and understanding genetic interactions using deep mutagenesis

Description du projet

Des méthodes de mutagenèse pour déterminer la structure protéique

Les mutations individuelles modifient la séquence des acides nucléiques et, selon leur emplacement, modifient potentiellement les protéines encodées. Toutefois, nous ne connaissons rien sur la manière dont des mutations différentes interagissent de manière non additive au sein, et entre les molécules pour affecter le phénotype et provoquer des maladies. Le projet MUTANOMICS, financé par l’UE, entend développer une mutagenèse systématique ou profonde ainsi que des méthodes de modélisation informatique afin de délimiter la structure 3D des protéines, notamment les protéines intrinsèquement désordonnées spécifiques à la maladie et à l’héritage épigénétique. En outre, l’équipe du projet fera la lumière sur l’impact des interactions de la mutation sur des phénotypes globaux, ce qui permettra de tirer des conclusions significatives concernant l’évolution, l’ingénierie et la maladie humaine.

Objectif

The goal of my research is to understand mutations and how they interact to alter phenotypes and disease. We recently initiated a new research direction that uses systematic (‘deep’) mutagenesis to quantify, understand, and predict how diverse mutations interact non-additively within and between molecules to affect phenotypes at multiple scales. Very excitingly, we have also shown that quantifying genetic interactions by deep mutagenesis provides sufficient information to determine the 3D structures of proteins. In this project we will leverage this experience in deep mutagenesis and computational modelling to address three specific aims:

1. To develop simple generic experimental and computational methods to determine the in vivo structures of proteins using deep mutagenesis and to apply these methods to solve the structures of domains of unknown structure.

2. To use deep mutagenesis and computational modelling to understand how mutations globally interact within and between molecules, when these interactions can – and cannot – be predicted from phenotypic measurements alone, and how these interactions alter in response to changes in gene expression.

3. To use deep mutagenesis to understand the cellular toxicity of pathological prion-like domains and to reveal the in vivo structures of these ‘unstructured’ regions, as well as those of disordered proteins that function as agents of protein-based epigenetic inheritance.

Taken together, this will provide rich insights into how mutations combine to alter phenotypes, a question of central importance to evolution, engineering, and human disease. It will also develop methods that use deep mutagenesis to determine protein structures, including of intrinsically disordered proteins relevant to disease and epigenetic inheritance. Our goal is to develop techniques that will allow labs across the world to use deep mutagenesis to solve protein structures, including potentially in large-scale systematic projects.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Mots‑clés

Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).

Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

ERC-ADG - Advanced Grant

Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme de financement

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2019-ADG

Voir tous les projets financés au titre de cet appel

Institution d’accueil

FUNDACIO CENTRE DE REGULACIO GENOMICA
Contribution nette de l'UE

La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.

€ 2 333 279,00
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

€ 2 333 279,00

Bénéficiaires (1)

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