Skip to main content
Przejdź do strony domowej Komisji Europejskiej (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
polski polski
CORDIS - Wyniki badań wspieranych przez UE
CORDIS

Determining in vivo protein structures and understanding genetic interactions using deep mutagenesis

Opis projektu

Wykorzystanie metod mutagenezy w celu określenia struktury białek

Poszczególne mutacje zmieniają sekwencję kwasu nukleinowego i, w zależności od lokalizacji, mogą zmienić zakodowane białka. Jednakże nieznany jest sposób, w jaki różne mutacje wchodzą w nieaddytywne interakcje w obrębie molekuł i pomiędzy nimi, wpływając tym samym na fenotyp i powodując chorobę. W ramach finansowanego przez UE projektu MUTANOMICS naukowcy opracują metody systematycznej lub głębokiej mutagenezy i modelowania komputerowego, aby określić trójwymiarową strukturę białek, zwłaszcza samoistnie nieuporządkowanych białek mających znaczenie w kontekście choroby i dziedziczenia epigenetycznego. Ponadto badacze dokładniej zbadają wpływ interakcji mutacji na globalne fenotypy, co niesie za sobą ważne konsekwencje dla rozwoju, inżynierii i chorób ludzkich.

Cel

The goal of my research is to understand mutations and how they interact to alter phenotypes and disease. We recently initiated a new research direction that uses systematic (‘deep’) mutagenesis to quantify, understand, and predict how diverse mutations interact non-additively within and between molecules to affect phenotypes at multiple scales. Very excitingly, we have also shown that quantifying genetic interactions by deep mutagenesis provides sufficient information to determine the 3D structures of proteins. In this project we will leverage this experience in deep mutagenesis and computational modelling to address three specific aims:

1. To develop simple generic experimental and computational methods to determine the in vivo structures of proteins using deep mutagenesis and to apply these methods to solve the structures of domains of unknown structure.

2. To use deep mutagenesis and computational modelling to understand how mutations globally interact within and between molecules, when these interactions can – and cannot – be predicted from phenotypic measurements alone, and how these interactions alter in response to changes in gene expression.

3. To use deep mutagenesis to understand the cellular toxicity of pathological prion-like domains and to reveal the in vivo structures of these ‘unstructured’ regions, as well as those of disordered proteins that function as agents of protein-based epigenetic inheritance.

Taken together, this will provide rich insights into how mutations combine to alter phenotypes, a question of central importance to evolution, engineering, and human disease. It will also develop methods that use deep mutagenesis to determine protein structures, including of intrinsically disordered proteins relevant to disease and epigenetic inheritance. Our goal is to develop techniques that will allow labs across the world to use deep mutagenesis to solve protein structures, including potentially in large-scale systematic projects.

Dziedzina nauki (EuroSciVoc)

Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.

Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować

Słowa kluczowe

Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.

Program(-y)

Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.

Temat(-y)

Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.

System finansowania

Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.

ERC-ADG - Advanced Grant

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania

Zaproszenie do składania wniosków

Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.

(odnośnik otworzy się w nowym oknie) ERC-2019-ADG

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszenia

Instytucja przyjmująca

FUNDACIO CENTRE DE REGULACIO GENOMICA
Wkład UE netto

Kwota netto dofinansowania ze środków Unii Europejskiej. Suma środków otrzymanych przez uczestnika, pomniejszona o kwotę unijnego dofinansowania przekazanego powiązanym podmiotom zewnętrznym. Uwzględnia podział unijnego dofinansowania pomiędzy bezpośrednich beneficjentów projektu i pozostałych uczestników, w tym podmioty zewnętrzne.

€ 2 333 279,00
Koszt całkowity

Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.

€ 2 333 279,00

Beneficjenci (1)

Moja broszura 0 0