Overcoming chromatin restricted DNA access

Información del proyecto

DNAccess

Identificador del acuerdo de subvención: 884664

DOI

10.3030/884664

Fecha de la firma de la CE 15 Octubre 2020

Fecha de inicio 1 Marzo 2021

Fecha de finalización 28 Febrero 2026

Financiado con arreglo a

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coste total

€ 2 302 500,00

Aportación de la UE

€ 2 302 500,00

Coordinado por

FRIEDRICH MIESCHER INSTITUTE FOR BIOMEDICAL RESEARCH FONDATION
Switzerland

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Publicaciones

Peer reviewed articles (7)

Generating specificity in genome regulation through transcription factor sensitivity to chromatin

Autores: Luke Isbel, Ralph S. Grand & Dirk Schübeler
Publicado en: Nature Reviews Genetics, 2022, ISSN 1471-0056
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41576-022-00512-6

Readout of histone methylation by Trim24 locally restricts chromatin opening by p53

Autores: Luke Isbel, Murat Iskar, Sevi Durdu, Joscha Weiss, Ralph S. Grand, Eric Hietter-Pfeiffer, Zuzanna Kozicka, Alicia K. Michael, Lukas Burger, Nicolas H. Thomä & Dirk Schübeler
Publicado en: Nature Structural & Molecular Biology, 2023, ISSN 1545-9993
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41594-023-01021-8

Cancer lineage-specific regulation of YAP responsive elements revealed through large-scale functional epigenomic screens

Autores: Inês A. M. Barbosa, Rajaraman Gopalakrishnan, Samuele Mercan, Thanos P. Mourikis, Typhaine Martin, Simon Wengert, Caibin Sheng, Fei Ji, Rui Lopes, Judith Knehr, Marc Altorfer, Alicia Lindeman, Carsten Russ, Ulrike Naumann, Javad Golji, Kathleen Sprouffske, Louise Barys, Luca Tordella, Dirk Schübeler, Tobias Schmelzle & Giorgio G. Galli
Publicado en: Nature Communications, 2023, ISSN 2041-1723
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-39527-w

Evidence that direct inhibition of transcription factor binding is the prevailing mode of gene and repeat repression by DNA methylation

Autores: Sebastian Kaluscha, Silvia Domcke, Christiane Wirbelauer, Michael B Stadler, Sevi Durdu, Lukas Burger , Dirk Schübeler
Publicado en: Nature Genetics, 2022, ISSN 1061-4036
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41588-022-01241-6

Cooperation between bHLH transcription factors and histones for DNA access

Autores: Alicia K. Michael, Lisa Stoos, Priya Crosby, Nikolas Eggers, Xinyu Y. Nie, Kristina Makasheva, Martina Minnich, Kelly L. Healy, Joscha Weiss, Georg Kempf, Simone Cavadini, Lukas Kater, Jan Seebacher, Luca Vecchia, Deyasini Chakraborty, Luke Isbel, Ralph S. Grand, Florian Andersch, Jennifer L. Fribourgh, Dirk Schübeler, Johannes Zuber, Andrew C. Liu, Peter B. Becker, Beat Fierz, …Nicolas H. Thom
Publicado en: nature, 2023, ISSN 0028-0836
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-023-06282-3

DNA sequence and chromatin modifiers cooperate to confer epigenetic bistability at imprinting control regions

Autores: Stefan Butz, Nina Schmolka, Ino D. Karemaker, Rodrigo Villaseñor, Isabel Schwarz, Silvia Domcke, Esther C. H. Uijttewaal, Julian Jude, Florian Lienert, Arnaud R. Krebs, Nathalie P. de Wagenaar, Xue Bao, Johannes Zuber, Ulrich Elling, Dirk Schübeler & Tuncay Baubec
Publicado en: Nature Genetics, Edición 10614036, 2022, ISSN 1061-4036
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41588-022-01210-z

ZFP462 safeguards neural lineage specification by targeting G9A/GLP-mediated heterochromatin to silence enhancers

Autores: Ramesh Yelagandula, Karin Stecher, Maria Novatchkova, Luca Michetti, Georg Michlits, Jingkui Wang, Pablo Hofbauer, Gintautas Vainorius, Carina Pribitzer, Luke Isbel, Sasha Mendjan, Dirk Schübeler, Ulrich Elling, Julius Brennecke & Oliver Bell
Publicado en: Nature Cell Biology, 2023, ISSN 1465-7392
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41556-022-01051-2