Overcoming chromatin restricted DNA access

Projektinformationen

DNAccess

ID Finanzhilfevereinbarung: 884664

DOI

10.3030/884664

EK-Unterschriftsdatum 15 Oktober 2020

Startdatum 1 März 2021

Enddatum 28 Februar 2026

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten

€ 2 302 500,00

EU-Beitrag

€ 2 302 500,00

Koordiniert durch

FRIEDRICH MIESCHER INSTITUTE FOR BIOMEDICAL RESEARCH FONDATION
Switzerland

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Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (7)

Generating specificity in genome regulation through transcription factor sensitivity to chromatin

Autoren: Luke Isbel, Ralph S. Grand & Dirk Schübeler
Veröffentlicht in: Nature Reviews Genetics, 2022, ISSN 1471-0056
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41576-022-00512-6

Readout of histone methylation by Trim24 locally restricts chromatin opening by p53

Autoren: Luke Isbel, Murat Iskar, Sevi Durdu, Joscha Weiss, Ralph S. Grand, Eric Hietter-Pfeiffer, Zuzanna Kozicka, Alicia K. Michael, Lukas Burger, Nicolas H. Thomä & Dirk Schübeler
Veröffentlicht in: Nature Structural & Molecular Biology, 2023, ISSN 1545-9993
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41594-023-01021-8

Cancer lineage-specific regulation of YAP responsive elements revealed through large-scale functional epigenomic screens

Autoren: Inês A. M. Barbosa, Rajaraman Gopalakrishnan, Samuele Mercan, Thanos P. Mourikis, Typhaine Martin, Simon Wengert, Caibin Sheng, Fei Ji, Rui Lopes, Judith Knehr, Marc Altorfer, Alicia Lindeman, Carsten Russ, Ulrike Naumann, Javad Golji, Kathleen Sprouffske, Louise Barys, Luca Tordella, Dirk Schübeler, Tobias Schmelzle & Giorgio G. Galli
Veröffentlicht in: Nature Communications, 2023, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-39527-w

Evidence that direct inhibition of transcription factor binding is the prevailing mode of gene and repeat repression by DNA methylation

Autoren: Sebastian Kaluscha, Silvia Domcke, Christiane Wirbelauer, Michael B Stadler, Sevi Durdu, Lukas Burger , Dirk Schübeler
Veröffentlicht in: Nature Genetics, 2022, ISSN 1061-4036
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41588-022-01241-6

Cooperation between bHLH transcription factors and histones for DNA access

Autoren: Alicia K. Michael, Lisa Stoos, Priya Crosby, Nikolas Eggers, Xinyu Y. Nie, Kristina Makasheva, Martina Minnich, Kelly L. Healy, Joscha Weiss, Georg Kempf, Simone Cavadini, Lukas Kater, Jan Seebacher, Luca Vecchia, Deyasini Chakraborty, Luke Isbel, Ralph S. Grand, Florian Andersch, Jennifer L. Fribourgh, Dirk Schübeler, Johannes Zuber, Andrew C. Liu, Peter B. Becker, Beat Fierz, …Nicolas H. Thom
Veröffentlicht in: nature, 2023, ISSN 0028-0836
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-023-06282-3

DNA sequence and chromatin modifiers cooperate to confer epigenetic bistability at imprinting control regions

Autoren: Stefan Butz, Nina Schmolka, Ino D. Karemaker, Rodrigo Villaseñor, Isabel Schwarz, Silvia Domcke, Esther C. H. Uijttewaal, Julian Jude, Florian Lienert, Arnaud R. Krebs, Nathalie P. de Wagenaar, Xue Bao, Johannes Zuber, Ulrich Elling, Dirk Schübeler & Tuncay Baubec
Veröffentlicht in: Nature Genetics, Ausgabe 10614036, 2022, ISSN 1061-4036
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41588-022-01210-z

ZFP462 safeguards neural lineage specification by targeting G9A/GLP-mediated heterochromatin to silence enhancers

Autoren: Ramesh Yelagandula, Karin Stecher, Maria Novatchkova, Luca Michetti, Georg Michlits, Jingkui Wang, Pablo Hofbauer, Gintautas Vainorius, Carina Pribitzer, Luke Isbel, Sasha Mendjan, Dirk Schübeler, Ulrich Elling, Julius Brennecke & Oliver Bell
Veröffentlicht in: Nature Cell Biology, 2023, ISSN 1465-7392
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41556-022-01051-2