Overcoming chromatin restricted DNA access

Informations projet

DNAccess

N° de convention de subvention: 884664

DOI

10.3030/884664

Date de signature de la CE 15 Octobre 2020

Date de début 1 Mars 2021

Date de fin 28 Février 2026

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 2 302 500,00

Contribution de l’UE

€ 2 302 500,00

Coordonné par

FRIEDRICH MIESCHER INSTITUTE FOR BIOMEDICAL RESEARCH FONDATION
Switzerland

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Publications

Peer reviewed articles (7)

Generating specificity in genome regulation through transcription factor sensitivity to chromatin

Auteurs: Luke Isbel, Ralph S. Grand & Dirk Schübeler
Publié dans: Nature Reviews Genetics, 2022, ISSN 1471-0056
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41576-022-00512-6

Readout of histone methylation by Trim24 locally restricts chromatin opening by p53

Auteurs: Luke Isbel, Murat Iskar, Sevi Durdu, Joscha Weiss, Ralph S. Grand, Eric Hietter-Pfeiffer, Zuzanna Kozicka, Alicia K. Michael, Lukas Burger, Nicolas H. Thomä & Dirk Schübeler
Publié dans: Nature Structural & Molecular Biology, 2023, ISSN 1545-9993
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41594-023-01021-8

Cancer lineage-specific regulation of YAP responsive elements revealed through large-scale functional epigenomic screens

Auteurs: Inês A. M. Barbosa, Rajaraman Gopalakrishnan, Samuele Mercan, Thanos P. Mourikis, Typhaine Martin, Simon Wengert, Caibin Sheng, Fei Ji, Rui Lopes, Judith Knehr, Marc Altorfer, Alicia Lindeman, Carsten Russ, Ulrike Naumann, Javad Golji, Kathleen Sprouffske, Louise Barys, Luca Tordella, Dirk Schübeler, Tobias Schmelzle & Giorgio G. Galli
Publié dans: Nature Communications, 2023, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-39527-w

Evidence that direct inhibition of transcription factor binding is the prevailing mode of gene and repeat repression by DNA methylation

Auteurs: Sebastian Kaluscha, Silvia Domcke, Christiane Wirbelauer, Michael B Stadler, Sevi Durdu, Lukas Burger , Dirk Schübeler
Publié dans: Nature Genetics, 2022, ISSN 1061-4036
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41588-022-01241-6

Cooperation between bHLH transcription factors and histones for DNA access

Auteurs: Alicia K. Michael, Lisa Stoos, Priya Crosby, Nikolas Eggers, Xinyu Y. Nie, Kristina Makasheva, Martina Minnich, Kelly L. Healy, Joscha Weiss, Georg Kempf, Simone Cavadini, Lukas Kater, Jan Seebacher, Luca Vecchia, Deyasini Chakraborty, Luke Isbel, Ralph S. Grand, Florian Andersch, Jennifer L. Fribourgh, Dirk Schübeler, Johannes Zuber, Andrew C. Liu, Peter B. Becker, Beat Fierz, …Nicolas H. Thom
Publié dans: nature, 2023, ISSN 0028-0836
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-023-06282-3

DNA sequence and chromatin modifiers cooperate to confer epigenetic bistability at imprinting control regions

Auteurs: Stefan Butz, Nina Schmolka, Ino D. Karemaker, Rodrigo Villaseñor, Isabel Schwarz, Silvia Domcke, Esther C. H. Uijttewaal, Julian Jude, Florian Lienert, Arnaud R. Krebs, Nathalie P. de Wagenaar, Xue Bao, Johannes Zuber, Ulrich Elling, Dirk Schübeler & Tuncay Baubec
Publié dans: Nature Genetics, Numéro 10614036, 2022, ISSN 1061-4036
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41588-022-01210-z

ZFP462 safeguards neural lineage specification by targeting G9A/GLP-mediated heterochromatin to silence enhancers

Auteurs: Ramesh Yelagandula, Karin Stecher, Maria Novatchkova, Luca Michetti, Georg Michlits, Jingkui Wang, Pablo Hofbauer, Gintautas Vainorius, Carina Pribitzer, Luke Isbel, Sasha Mendjan, Dirk Schübeler, Ulrich Elling, Julius Brennecke & Oliver Bell
Publié dans: Nature Cell Biology, 2023, ISSN 1465-7392
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41556-022-01051-2