Descripción del proyecto
Estudio de la función de los fagos en la acuicultura
Se cree que los fagos, como depredadores bacterianos naturales, influyen en la acuicultura y resulta crucial comprender su función en el control sostenible e inocuo de los patógenos. El proyecto financiado con fondos europeos DYNAMIC se propone desvelar procesos evolutivos y ecológicos esenciales, prestando especial atención a la dinámica entre fagos y bacterias en el entorno marino. El proyecto utilizará como modelo un patógeno bacteriano de la ostra llamado «Vibrio crassostreae» y sus fagos infecciosos para explorar las bases moleculares y la evolución de las infecciones de fagos en la naturaleza. Al utilizar metodología de campo, especificará si los fagos afectan a la dinámica de los «V. crassostreae» en la naturaleza y si la coevolución influye en este sistema natural. DYNAMIC combinará la genómica funcional y comparativa para detectar genes relacionados con los diversos hospedadores de fagos, la resistencia de los hospedadores y la coevolución de fagos y hospedadores, y obtendrá nuevos datos para tratamientos con fagos en la acuicultura.
Objetivo
Facing the therapeutic impasse of antibiotics, farming systems, among which aquaculture, should consider the extraordinary resource of phages, the natural bacterial predators, for environmental friendly practices. It is, however, crucial to understand how phages can control pathogens in a sustainable and safety manner. The goal of this project is to shed light on key ecological and evolutionary processes underlying phage-bacteria dynamics in the marine environment. An oyster bacterial pathogen, Vibrio crassostreae and its infecting phages will be used as model system to investigate the molecular bases and evolution of phage infections in nature. Based on a field approach, we will determine whether phages influence V. crassostreae dynamics in the wild by reducing bacterial density via predation and if co-evolution applies in this natural system. Combining comparative and functional genomics we will identify genes involved in the phage host range, host resistance, and phage–host coevolution. Exploring phage-vibrio interactions in culture, we will analyze whether fitness costs can constrain evolution of resistance in oyster hemolymph. We will identify vibrio virulence genes that are negatively selected by phages. In addition we will study whether phages in combination act synergistically to control V. crassostreae. Focusing on a T4-giant phage as a model, we will assess the molecular mechanisms underpinning its broad host range and decipher its potential to spread bacterial genes by horizontal gene transfer. We will finally revisit the phylogenomics of T4-related phages, and reconstruct the T4-giant phage ancestral genome to determine how the ability to infect multiple hosts has evolved in this group. This project has significant potential to make truly ground breaking discoveries on phage-bacteria coevolution providing new and major knowledge for the future generation of phage therapy in aquaculture.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural.
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Palabras clave
Programa(s)
Régimen de financiación
ERC-ADG - Advanced GrantInstitución de acogida
29280 Plouzane
Francia