Description du projet
Examiner le rôle des phages dans l’aquaculture
En tant que prédateurs bactériens naturels, les phages joueraient un rôle dans l’aquaculture. Il est essentiel de comprendre le rôle des phages dans la lutte durable et inoffensive contre les agents pathogènes. Le projet DYNAMIC, financé par l’UE, a pour but de révéler des processus écologiques et évolutifs essentiels, en se concentrant sur la dynamique des bactériophages dans l’environnement marin. Comme modèle, le projet utilisera une bactérie pathogène des huîtres appelée Vibrio crassostreae et ses phages infectants pour examiner les bases moléculaires et l’évolution des infections de phages dans la nature. En utilisant une méthodologie de terrain, il déterminera si les phages affectent la dynamique de V. crassostreae dans la nature et si la co-évolution influence ce système naturel. DYNAMIC combinera la génomique comparative et fonctionnelle pour détecter les gènes liés à la gamme d’hôtes des phages, à la résistance des hôtes et à la co-évolution phages-hôtes, fournissant ainsi de nouvelles connaissances pour le traitement des phages en aquaculture.
Objectif
Facing the therapeutic impasse of antibiotics, farming systems, among which aquaculture, should consider the extraordinary resource of phages, the natural bacterial predators, for environmental friendly practices. It is, however, crucial to understand how phages can control pathogens in a sustainable and safety manner. The goal of this project is to shed light on key ecological and evolutionary processes underlying phage-bacteria dynamics in the marine environment. An oyster bacterial pathogen, Vibrio crassostreae and its infecting phages will be used as model system to investigate the molecular bases and evolution of phage infections in nature. Based on a field approach, we will determine whether phages influence V. crassostreae dynamics in the wild by reducing bacterial density via predation and if co-evolution applies in this natural system. Combining comparative and functional genomics we will identify genes involved in the phage host range, host resistance, and phage–host coevolution. Exploring phage-vibrio interactions in culture, we will analyze whether fitness costs can constrain evolution of resistance in oyster hemolymph. We will identify vibrio virulence genes that are negatively selected by phages. In addition we will study whether phages in combination act synergistically to control V. crassostreae. Focusing on a T4-giant phage as a model, we will assess the molecular mechanisms underpinning its broad host range and decipher its potential to spread bacterial genes by horizontal gene transfer. We will finally revisit the phylogenomics of T4-related phages, and reconstruct the T4-giant phage ancestral genome to determine how the ability to infect multiple hosts has evolved in this group. This project has significant potential to make truly ground breaking discoveries on phage-bacteria coevolution providing new and major knowledge for the future generation of phage therapy in aquaculture.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN.
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN.
- sciences naturellessciences biologiquesmicrobiologievirologie
- sciences naturellessciences biologiquesbiologie de l'évolution
- sciences naturellessciences biologiquessciences biologiques du comportementéthologieinteraction biologique
- sciences agricolesagriculture, sylviculture et pêcheagriculture
- sciences naturellessciences biologiquesgénétiquegénome
Vous devez vous identifier ou vous inscrire pour utiliser cette fonction
Programme(s)
Thème(s)
Régime de financement
ERC-ADG - Advanced GrantInstitution d’accueil
29280 Plouzane
France